Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE4

Scyl2, SCY1-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 930 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scyl2Q8CFE4 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Scyl2Q8CFE4 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Scyl2Q8CFE4 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Scyl2Q8CFE4 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Scyl2Q8CFE4 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Scyl2Q8CFE4 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Scyl2Q8CFE4 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Scyl2Q8CFE4 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Scyl2Q8CFE4 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Scyl2Q8CFE4 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Scyl2Q8CFE4 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Scyl2Q8CFE4 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Scyl2Q8CFE4 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Scyl2Q8CFE4 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Scyl2Q8CFE4 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Scyl2Q8CFE4 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Scyl2Q8CFE4 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Scyl2Q8CFE4 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Scyl2Q8CFE4 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Scyl2Q8CFE4 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Scyl2Q8CFE4 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Scyl2Q8CFE4 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Scyl2Q8CFE4 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Scyl2Q8CFE4 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Scyl2Q8CFE4 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Scyl2Q8CFE4 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Scyl2Q8CFE4 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Scyl2Q8CFE4 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Scyl2Q8CFE4 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Scyl2Q8CFE4 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Scyl2Q8CFE4 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Scyl2Q8CFE4 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Scyl2Q8CFE4 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Scyl2Q8CFE4 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Scyl2Q8CFE4 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Scyl2Q8CFE4 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Scyl2Q8CFE4 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Scyl2Q8CFE4 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Scyl2Q8CFE4 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Scyl2Q8CFE4 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Scyl2Q8CFE4 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Scyl2Q8CFE4 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Scyl2Q8CFE4 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Scyl2Q8CFE4 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Scyl2Q8CFE4 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Scyl2Q8CFE4 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Scyl2Q8CFE4 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Scyl2Q8CFE4 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Scyl2Q8CFE4 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scyl2Q8CFE4 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scyl2Q8CFE4 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scyl2Q8CFE4 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scyl2Q8CFE4 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scyl2Q8CFE4 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scyl2Q8CFE4 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scyl2Q8CFE4 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scyl2Q8CFE4 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scyl2Q8CFE4 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scyl2Q8CFE4 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scyl2Q8CFE4 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scyl2Q8CFE4 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scyl2Q8CFE4 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scyl2Q8CFE4 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scyl2Q8CFE4 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scyl2Q8CFE4 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scyl2Q8CFE4 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scyl2Q8CFE4 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Scyl2Q8CFE4 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scyl2Q8CFE4 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scyl2Q8CFE4 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scyl2Q8CFE4 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Scyl2Q8CFE4 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Scyl2Q8CFE4 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Scyl2Q8CFE4 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Scyl2Q8CFE4 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Scyl2Q8CFE4 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Scyl2Q8CFE4 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Scyl2Q8CFE4 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Scyl2Q8CFE4 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Scyl2Q8CFE4 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Scyl2Q8CFE4 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Scyl2Q8CFE4 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Scyl2Q8CFE4 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Scyl2Q8CFE4 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Scyl2Q8CFE4 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Scyl2Q8CFE4 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Scyl2Q8CFE4 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Scyl2Q8CFE4 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Scyl2Q8CFE4 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Scyl2Q8CFE4 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Scyl2Q8CFE4 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Scyl2Q8CFE4 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Scyl2Q8CFE4 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Scyl2Q8CFE4 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Scyl2Q8CFE4 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Scyl2Q8CFE4 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Scyl2Q8CFE4 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Scyl2Q8CFE4 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Scyl2Q8CFE4 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Scyl2Q8CFE4 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 118.3 ms