Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEC0

Nup88, Nuclear pore complex protein Nup88, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup88Q8CEC0 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nup88Q8CEC0 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nup88Q8CEC0 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nup88Q8CEC0 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nup88Q8CEC0 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nup88Q8CEC0 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nup88Q8CEC0 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nup88Q8CEC0 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nup88Q8CEC0 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nup88Q8CEC0 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nup88Q8CEC0 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nup88Q8CEC0 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nup88Q8CEC0 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nup88Q8CEC0 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nup88Q8CEC0 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nup88Q8CEC0 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nup88Q8CEC0 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Nup88Q8CEC0 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nup88Q8CEC0 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Nup88Q8CEC0 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nup88Q8CEC0 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nup88Q8CEC0 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nup88Q8CEC0 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nup88Q8CEC0 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nup88Q8CEC0 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nup88Q8CEC0 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nup88Q8CEC0 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nup88Q8CEC0 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nup88Q8CEC0 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nup88Q8CEC0 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nup88Q8CEC0 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nup88Q8CEC0 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nup88Q8CEC0 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nup88Q8CEC0 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nup88Q8CEC0 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nup88Q8CEC0 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nup88Q8CEC0 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nup88Q8CEC0 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nup88Q8CEC0 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nup88Q8CEC0 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nup88Q8CEC0 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nup88Q8CEC0 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nup88Q8CEC0 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nup88Q8CEC0 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nup88Q8CEC0 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nup88Q8CEC0 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nup88Q8CEC0 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nup88Q8CEC0 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nup88Q8CEC0 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Nup88Q8CEC0 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nup88Q8CEC0 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nup88Q8CEC0 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nup88Q8CEC0 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nup88Q8CEC0 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nup88Q8CEC0 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nup88Q8CEC0 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nup88Q8CEC0 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nup88Q8CEC0 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nup88Q8CEC0 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nup88Q8CEC0 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nup88Q8CEC0 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nup88Q8CEC0 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nup88Q8CEC0 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nup88Q8CEC0 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nup88Q8CEC0 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nup88Q8CEC0 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nup88Q8CEC0 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nup88Q8CEC0 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nup88Q8CEC0 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nup88Q8CEC0 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nup88Q8CEC0 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nup88Q8CEC0 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nup88Q8CEC0 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nup88Q8CEC0 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nup88Q8CEC0 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nup88Q8CEC0 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nup88Q8CEC0 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Nup88Q8CEC0 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Nup88Q8CEC0 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nup88Q8CEC0 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nup88Q8CEC0 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nup88Q8CEC0 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Nup88Q8CEC0 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nup88Q8CEC0 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nup88Q8CEC0 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nup88Q8CEC0 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nup88Q8CEC0 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nup88Q8CEC0 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nup88Q8CEC0 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nup88Q8CEC0 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nup88Q8CEC0 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nup88Q8CEC0 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nup88Q8CEC0 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nup88Q8CEC0 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nup88Q8CEC0 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nup88Q8CEC0 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nup88Q8CEC0 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nup88Q8CEC0 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nup88Q8CEC0 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nup88Q8CEC0 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms