Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDV0

Ccdc178, Coiled-coil domain-containing protein 178, mousemouse

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc178Q8CDV0 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc178Q8CDV0 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc178Q8CDV0 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc178Q8CDV0 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc178Q8CDV0 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc178Q8CDV0 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc178Q8CDV0 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc178Q8CDV0 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc178Q8CDV0 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc178Q8CDV0 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc178Q8CDV0 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc178Q8CDV0 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc178Q8CDV0 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc178Q8CDV0 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc178Q8CDV0 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc178Q8CDV0 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc178Q8CDV0 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc178Q8CDV0 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc178Q8CDV0 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc178Q8CDV0 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc178Q8CDV0 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc178Q8CDV0 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc178Q8CDV0 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc178Q8CDV0 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc178Q8CDV0 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc178Q8CDV0 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc178Q8CDV0 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc178Q8CDV0 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc178Q8CDV0 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc178Q8CDV0 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc178Q8CDV0 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc178Q8CDV0 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc178Q8CDV0 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc178Q8CDV0 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc178Q8CDV0 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc178Q8CDV0 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc178Q8CDV0 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc178Q8CDV0 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc178Q8CDV0 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc178Q8CDV0 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc178Q8CDV0 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc178Q8CDV0 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc178Q8CDV0 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc178Q8CDV0 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc178Q8CDV0 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc178Q8CDV0 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc178Q8CDV0 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc178Q8CDV0 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc178Q8CDV0 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc178Q8CDV0 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc178Q8CDV0 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc178Q8CDV0 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc178Q8CDV0 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc178Q8CDV0 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc178Q8CDV0 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc178Q8CDV0 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc178Q8CDV0 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc178Q8CDV0 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc178Q8CDV0 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc178Q8CDV0 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc178Q8CDV0 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc178Q8CDV0 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc178Q8CDV0 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc178Q8CDV0 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc178Q8CDV0 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc178Q8CDV0 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc178Q8CDV0 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc178Q8CDV0 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc178Q8CDV0 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc178Q8CDV0 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc178Q8CDV0 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc178Q8CDV0 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc178Q8CDV0 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc178Q8CDV0 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc178Q8CDV0 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc178Q8CDV0 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc178Q8CDV0 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc178Q8CDV0 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc178Q8CDV0 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc178Q8CDV0 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc178Q8CDV0 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ccdc178Q8CDV0 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ccdc178Q8CDV0 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ccdc178Q8CDV0 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc178Q8CDV0 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc178Q8CDV0 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc178Q8CDV0 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc178Q8CDV0 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc178Q8CDV0 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc178Q8CDV0 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc178Q8CDV0 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc178Q8CDV0 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc178Q8CDV0 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc178Q8CDV0 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc178Q8CDV0 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc178Q8CDV0 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc178Q8CDV0 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc178Q8CDV0 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc178Q8CDV0 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc178Q8CDV0 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms