Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDM4

Ccdc73, Coiled-coil domain-containing protein 73, mousemouse

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc73Q8CDM4 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc73Q8CDM4 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc73Q8CDM4 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc73Q8CDM4 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc73Q8CDM4 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc73Q8CDM4 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc73Q8CDM4 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc73Q8CDM4 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc73Q8CDM4 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc73Q8CDM4 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc73Q8CDM4 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc73Q8CDM4 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc73Q8CDM4 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc73Q8CDM4 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc73Q8CDM4 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc73Q8CDM4 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc73Q8CDM4 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc73Q8CDM4 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc73Q8CDM4 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc73Q8CDM4 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc73Q8CDM4 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc73Q8CDM4 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc73Q8CDM4 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc73Q8CDM4 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc73Q8CDM4 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc73Q8CDM4 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc73Q8CDM4 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc73Q8CDM4 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc73Q8CDM4 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc73Q8CDM4 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc73Q8CDM4 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc73Q8CDM4 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc73Q8CDM4 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc73Q8CDM4 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc73Q8CDM4 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc73Q8CDM4 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc73Q8CDM4 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc73Q8CDM4 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc73Q8CDM4 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc73Q8CDM4 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc73Q8CDM4 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc73Q8CDM4 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Ccdc73Q8CDM4 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Ccdc73Q8CDM4 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Ccdc73Q8CDM4 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc73Q8CDM4 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc73Q8CDM4 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc73Q8CDM4 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc73Q8CDM4 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc73Q8CDM4 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc73Q8CDM4 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc73Q8CDM4 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc73Q8CDM4 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc73Q8CDM4 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc73Q8CDM4 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc73Q8CDM4 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc73Q8CDM4 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc73Q8CDM4 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc73Q8CDM4 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc73Q8CDM4 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc73Q8CDM4 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc73Q8CDM4 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc73Q8CDM4 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc73Q8CDM4 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc73Q8CDM4 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc73Q8CDM4 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc73Q8CDM4 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc73Q8CDM4 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc73Q8CDM4 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc73Q8CDM4 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc73Q8CDM4 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc73Q8CDM4 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc73Q8CDM4 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc73Q8CDM4 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc73Q8CDM4 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc73Q8CDM4 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc73Q8CDM4 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc73Q8CDM4 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc73Q8CDM4 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc73Q8CDM4 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc73Q8CDM4 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc73Q8CDM4 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc73Q8CDM4 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc73Q8CDM4 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc73Q8CDM4 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc73Q8CDM4 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc73Q8CDM4 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc73Q8CDM4 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc73Q8CDM4 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc73Q8CDM4 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc73Q8CDM4 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc73Q8CDM4 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc73Q8CDM4 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc73Q8CDM4 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc73Q8CDM4 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc73Q8CDM4 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc73Q8CDM4 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc73Q8CDM4 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc73Q8CDM4 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc73Q8CDM4 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms