Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDL9

Ccdc87, Coiled-coil domain-containing protein 87, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc87Q8CDL9 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc87Q8CDL9 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc87Q8CDL9 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc87Q8CDL9 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc87Q8CDL9 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc87Q8CDL9 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc87Q8CDL9 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc87Q8CDL9 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc87Q8CDL9 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc87Q8CDL9 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc87Q8CDL9 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc87Q8CDL9 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc87Q8CDL9 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc87Q8CDL9 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ccdc87Q8CDL9 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ccdc87Q8CDL9 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc87Q8CDL9 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc87Q8CDL9 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc87Q8CDL9 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc87Q8CDL9 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc87Q8CDL9 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc87Q8CDL9 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc87Q8CDL9 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc87Q8CDL9 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc87Q8CDL9 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc87Q8CDL9 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc87Q8CDL9 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc87Q8CDL9 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc87Q8CDL9 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc87Q8CDL9 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc87Q8CDL9 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc87Q8CDL9 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc87Q8CDL9 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc87Q8CDL9 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc87Q8CDL9 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc87Q8CDL9 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc87Q8CDL9 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc87Q8CDL9 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc87Q8CDL9 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc87Q8CDL9 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc87Q8CDL9 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc87Q8CDL9 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc87Q8CDL9 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc87Q8CDL9 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc87Q8CDL9 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc87Q8CDL9 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc87Q8CDL9 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc87Q8CDL9 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc87Q8CDL9 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc87Q8CDL9 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc87Q8CDL9 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc87Q8CDL9 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc87Q8CDL9 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc87Q8CDL9 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc87Q8CDL9 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc87Q8CDL9 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc87Q8CDL9 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc87Q8CDL9 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc87Q8CDL9 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc87Q8CDL9 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc87Q8CDL9 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc87Q8CDL9 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc87Q8CDL9 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc87Q8CDL9 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc87Q8CDL9 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc87Q8CDL9 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc87Q8CDL9 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc87Q8CDL9 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc87Q8CDL9 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc87Q8CDL9 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc87Q8CDL9 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc87Q8CDL9 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc87Q8CDL9 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc87Q8CDL9 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc87Q8CDL9 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc87Q8CDL9 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc87Q8CDL9 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc87Q8CDL9 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc87Q8CDL9 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc87Q8CDL9 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc87Q8CDL9 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc87Q8CDL9 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc87Q8CDL9 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc87Q8CDL9 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc87Q8CDL9 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc87Q8CDL9 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc87Q8CDL9 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc87Q8CDL9 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc87Q8CDL9 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc87Q8CDL9 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc87Q8CDL9 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc87Q8CDL9 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc87Q8CDL9 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc87Q8CDL9 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc87Q8CDL9 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc87Q8CDL9 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc87Q8CDL9 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc87Q8CDL9 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc87Q8CDL9 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc87Q8CDL9 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms