Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD15

Riox2, Ribosomal oxygenase 2, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riox2Q8CD15 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Riox2Q8CD15 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Riox2Q8CD15 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Riox2Q8CD15 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Riox2Q8CD15 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Riox2Q8CD15 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Riox2Q8CD15 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Riox2Q8CD15 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Riox2Q8CD15 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Riox2Q8CD15 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Riox2Q8CD15 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Riox2Q8CD15 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Riox2Q8CD15 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Riox2Q8CD15 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Riox2Q8CD15 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Riox2Q8CD15 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Riox2Q8CD15 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Riox2Q8CD15 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Riox2Q8CD15 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Riox2Q8CD15 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Riox2Q8CD15 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Riox2Q8CD15 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Riox2Q8CD15 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Riox2Q8CD15 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Riox2Q8CD15 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Riox2Q8CD15 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Riox2Q8CD15 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Riox2Q8CD15 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Riox2Q8CD15 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Riox2Q8CD15 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Riox2Q8CD15 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Riox2Q8CD15 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Riox2Q8CD15 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Riox2Q8CD15 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Riox2Q8CD15 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Riox2Q8CD15 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Riox2Q8CD15 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Riox2Q8CD15 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Riox2Q8CD15 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Riox2Q8CD15 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Riox2Q8CD15 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Riox2Q8CD15 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Riox2Q8CD15 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Riox2Q8CD15 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Riox2Q8CD15 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Riox2Q8CD15 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Riox2Q8CD15 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Riox2Q8CD15 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Riox2Q8CD15 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Riox2Q8CD15 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Riox2Q8CD15 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Riox2Q8CD15 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Riox2Q8CD15 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Riox2Q8CD15 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Riox2Q8CD15 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Riox2Q8CD15 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Riox2Q8CD15 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Riox2Q8CD15 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Riox2Q8CD15 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Riox2Q8CD15 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Riox2Q8CD15 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Riox2Q8CD15 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Riox2Q8CD15 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Riox2Q8CD15 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Riox2Q8CD15 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Riox2Q8CD15 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Riox2Q8CD15 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Riox2Q8CD15 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Riox2Q8CD15 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Riox2Q8CD15 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Riox2Q8CD15 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Riox2Q8CD15 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Riox2Q8CD15 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Riox2Q8CD15 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Riox2Q8CD15 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Riox2Q8CD15 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Riox2Q8CD15 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Riox2Q8CD15 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Riox2Q8CD15 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Riox2Q8CD15 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Riox2Q8CD15 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Riox2Q8CD15 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Riox2Q8CD15 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Riox2Q8CD15 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Riox2Q8CD15 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Riox2Q8CD15 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Riox2Q8CD15 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Riox2Q8CD15 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Riox2Q8CD15 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Riox2Q8CD15 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Riox2Q8CD15 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Riox2Q8CD15 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Riox2Q8CD15 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Riox2Q8CD15 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Riox2Q8CD15 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Riox2Q8CD15 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Riox2Q8CD15 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Riox2Q8CD15 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Riox2Q8CD15 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Riox2Q8CD15 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms