Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCI5

Rybp, RING1 and YY1-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RybpQ8CCI5 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RybpQ8CCI5 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RybpQ8CCI5 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RybpQ8CCI5 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RybpQ8CCI5 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RybpQ8CCI5 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RybpQ8CCI5 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RybpQ8CCI5 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RybpQ8CCI5 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RybpQ8CCI5 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RybpQ8CCI5 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RybpQ8CCI5 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RybpQ8CCI5 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RybpQ8CCI5 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RybpQ8CCI5 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RybpQ8CCI5 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RybpQ8CCI5 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RybpQ8CCI5 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
RybpQ8CCI5 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RybpQ8CCI5 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
RybpQ8CCI5 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RybpQ8CCI5 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RybpQ8CCI5 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RybpQ8CCI5 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RybpQ8CCI5 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RybpQ8CCI5 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RybpQ8CCI5 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RybpQ8CCI5 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RybpQ8CCI5 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RybpQ8CCI5 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RybpQ8CCI5 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RybpQ8CCI5 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RybpQ8CCI5 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RybpQ8CCI5 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RybpQ8CCI5 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RybpQ8CCI5 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RybpQ8CCI5 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RybpQ8CCI5 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RybpQ8CCI5 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
RybpQ8CCI5 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RybpQ8CCI5 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RybpQ8CCI5 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RybpQ8CCI5 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RybpQ8CCI5 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RybpQ8CCI5 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RybpQ8CCI5 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RybpQ8CCI5 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RybpQ8CCI5 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
RybpQ8CCI5 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RybpQ8CCI5 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
RybpQ8CCI5 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RybpQ8CCI5 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RybpQ8CCI5 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RybpQ8CCI5 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RybpQ8CCI5 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RybpQ8CCI5 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RybpQ8CCI5 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
RybpQ8CCI5 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RybpQ8CCI5 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RybpQ8CCI5 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RybpQ8CCI5 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RybpQ8CCI5 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RybpQ8CCI5 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RybpQ8CCI5 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RybpQ8CCI5 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
RybpQ8CCI5 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
RybpQ8CCI5 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RybpQ8CCI5 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RybpQ8CCI5 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC19■□□□□ 0.63
RybpQ8CCI5 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RybpQ8CCI5 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RybpQ8CCI5 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC19■□□□□ 0.63
RybpQ8CCI5 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RybpQ8CCI5 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RybpQ8CCI5 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RybpQ8CCI5 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
RybpQ8CCI5 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RybpQ8CCI5 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RybpQ8CCI5 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RybpQ8CCI5 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RybpQ8CCI5 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RybpQ8CCI5 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RybpQ8CCI5 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RybpQ8CCI5 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RybpQ8CCI5 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RybpQ8CCI5 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RybpQ8CCI5 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RybpQ8CCI5 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RybpQ8CCI5 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RybpQ8CCI5 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
RybpQ8CCI5 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RybpQ8CCI5 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
RybpQ8CCI5 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RybpQ8CCI5 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RybpQ8CCI5 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RybpQ8CCI5 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RybpQ8CCI5 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RybpQ8CCI5 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RybpQ8CCI5 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RybpQ8CCI5 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms