Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nhlrc3Q8CCH2 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nhlrc3Q8CCH2 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nhlrc3Q8CCH2 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nhlrc3Q8CCH2 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nhlrc3Q8CCH2 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms