Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7U1

N4bp3, NEDD4-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
N4bp3Q8C7U1 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
N4bp3Q8C7U1 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
N4bp3Q8C7U1 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
N4bp3Q8C7U1 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
N4bp3Q8C7U1 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
N4bp3Q8C7U1 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
N4bp3Q8C7U1 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
N4bp3Q8C7U1 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
N4bp3Q8C7U1 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
N4bp3Q8C7U1 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
N4bp3Q8C7U1 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
N4bp3Q8C7U1 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
N4bp3Q8C7U1 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
N4bp3Q8C7U1 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
N4bp3Q8C7U1 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
N4bp3Q8C7U1 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
N4bp3Q8C7U1 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
N4bp3Q8C7U1 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
N4bp3Q8C7U1 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
N4bp3Q8C7U1 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
N4bp3Q8C7U1 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
N4bp3Q8C7U1 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
N4bp3Q8C7U1 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
N4bp3Q8C7U1 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
N4bp3Q8C7U1 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
N4bp3Q8C7U1 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
N4bp3Q8C7U1 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
N4bp3Q8C7U1 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
N4bp3Q8C7U1 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
N4bp3Q8C7U1 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
N4bp3Q8C7U1 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
N4bp3Q8C7U1 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
N4bp3Q8C7U1 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
N4bp3Q8C7U1 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
N4bp3Q8C7U1 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
N4bp3Q8C7U1 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
N4bp3Q8C7U1 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
N4bp3Q8C7U1 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
N4bp3Q8C7U1 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
N4bp3Q8C7U1 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
N4bp3Q8C7U1 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
N4bp3Q8C7U1 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
N4bp3Q8C7U1 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
N4bp3Q8C7U1 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
N4bp3Q8C7U1 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
N4bp3Q8C7U1 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
N4bp3Q8C7U1 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
N4bp3Q8C7U1 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
N4bp3Q8C7U1 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
N4bp3Q8C7U1 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
N4bp3Q8C7U1 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
N4bp3Q8C7U1 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
N4bp3Q8C7U1 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
N4bp3Q8C7U1 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
N4bp3Q8C7U1 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
N4bp3Q8C7U1 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
N4bp3Q8C7U1 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
N4bp3Q8C7U1 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
N4bp3Q8C7U1 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
N4bp3Q8C7U1 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
N4bp3Q8C7U1 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
N4bp3Q8C7U1 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
N4bp3Q8C7U1 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
N4bp3Q8C7U1 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
N4bp3Q8C7U1 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
N4bp3Q8C7U1 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
N4bp3Q8C7U1 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
N4bp3Q8C7U1 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
N4bp3Q8C7U1 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
N4bp3Q8C7U1 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
N4bp3Q8C7U1 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
N4bp3Q8C7U1 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
N4bp3Q8C7U1 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
N4bp3Q8C7U1 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
N4bp3Q8C7U1 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
N4bp3Q8C7U1 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
N4bp3Q8C7U1 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
N4bp3Q8C7U1 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
N4bp3Q8C7U1 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
N4bp3Q8C7U1 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
N4bp3Q8C7U1 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
N4bp3Q8C7U1 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
N4bp3Q8C7U1 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
N4bp3Q8C7U1 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
N4bp3Q8C7U1 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
N4bp3Q8C7U1 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
N4bp3Q8C7U1 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
N4bp3Q8C7U1 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
N4bp3Q8C7U1 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
N4bp3Q8C7U1 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
N4bp3Q8C7U1 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
N4bp3Q8C7U1 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
N4bp3Q8C7U1 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
N4bp3Q8C7U1 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
N4bp3Q8C7U1 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
N4bp3Q8C7U1 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
N4bp3Q8C7U1 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
N4bp3Q8C7U1 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
N4bp3Q8C7U1 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
N4bp3Q8C7U1 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms