Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5Z9

4930504O13Rik, RIKEN cDNA 4930504O13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930504O13RikQ8C5Z9 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
4930504O13RikQ8C5Z9 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
4930504O13RikQ8C5Z9 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
4930504O13RikQ8C5Z9 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
4930504O13RikQ8C5Z9 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
4930504O13RikQ8C5Z9 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
4930504O13RikQ8C5Z9 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
4930504O13RikQ8C5Z9 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
4930504O13RikQ8C5Z9 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
4930504O13RikQ8C5Z9 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
4930504O13RikQ8C5Z9 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
4930504O13RikQ8C5Z9 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
4930504O13RikQ8C5Z9 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
4930504O13RikQ8C5Z9 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
4930504O13RikQ8C5Z9 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
4930504O13RikQ8C5Z9 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
4930504O13RikQ8C5Z9 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
4930504O13RikQ8C5Z9 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
4930504O13RikQ8C5Z9 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
4930504O13RikQ8C5Z9 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
4930504O13RikQ8C5Z9 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
4930504O13RikQ8C5Z9 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
4930504O13RikQ8C5Z9 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
4930504O13RikQ8C5Z9 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
4930504O13RikQ8C5Z9 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
4930504O13RikQ8C5Z9 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
4930504O13RikQ8C5Z9 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
4930504O13RikQ8C5Z9 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
4930504O13RikQ8C5Z9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
4930504O13RikQ8C5Z9 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
4930504O13RikQ8C5Z9 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
4930504O13RikQ8C5Z9 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
4930504O13RikQ8C5Z9 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
4930504O13RikQ8C5Z9 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
4930504O13RikQ8C5Z9 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
4930504O13RikQ8C5Z9 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
4930504O13RikQ8C5Z9 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
4930504O13RikQ8C5Z9 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
4930504O13RikQ8C5Z9 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
4930504O13RikQ8C5Z9 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
4930504O13RikQ8C5Z9 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
4930504O13RikQ8C5Z9 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
4930504O13RikQ8C5Z9 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
4930504O13RikQ8C5Z9 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
4930504O13RikQ8C5Z9 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
4930504O13RikQ8C5Z9 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
4930504O13RikQ8C5Z9 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
4930504O13RikQ8C5Z9 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
4930504O13RikQ8C5Z9 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
4930504O13RikQ8C5Z9 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
4930504O13RikQ8C5Z9 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
4930504O13RikQ8C5Z9 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
4930504O13RikQ8C5Z9 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
4930504O13RikQ8C5Z9 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
4930504O13RikQ8C5Z9 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
4930504O13RikQ8C5Z9 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
4930504O13RikQ8C5Z9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
4930504O13RikQ8C5Z9 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
4930504O13RikQ8C5Z9 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
4930504O13RikQ8C5Z9 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
4930504O13RikQ8C5Z9 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
4930504O13RikQ8C5Z9 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
4930504O13RikQ8C5Z9 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
4930504O13RikQ8C5Z9 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
4930504O13RikQ8C5Z9 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
4930504O13RikQ8C5Z9 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
4930504O13RikQ8C5Z9 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
4930504O13RikQ8C5Z9 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
4930504O13RikQ8C5Z9 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
4930504O13RikQ8C5Z9 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
4930504O13RikQ8C5Z9 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
4930504O13RikQ8C5Z9 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
4930504O13RikQ8C5Z9 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
4930504O13RikQ8C5Z9 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
4930504O13RikQ8C5Z9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
4930504O13RikQ8C5Z9 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
4930504O13RikQ8C5Z9 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
4930504O13RikQ8C5Z9 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
4930504O13RikQ8C5Z9 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
4930504O13RikQ8C5Z9 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
4930504O13RikQ8C5Z9 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
4930504O13RikQ8C5Z9 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
4930504O13RikQ8C5Z9 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
4930504O13RikQ8C5Z9 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
4930504O13RikQ8C5Z9 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
4930504O13RikQ8C5Z9 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
4930504O13RikQ8C5Z9 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
4930504O13RikQ8C5Z9 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
4930504O13RikQ8C5Z9 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
4930504O13RikQ8C5Z9 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
4930504O13RikQ8C5Z9 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
4930504O13RikQ8C5Z9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
4930504O13RikQ8C5Z9 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
4930504O13RikQ8C5Z9 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms