Protein–RNA interactions for Protein: Q8C4J0

Ccdc60, Coiled-coil domain-containing protein 60, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc60Q8C4J0 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc60Q8C4J0 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc60Q8C4J0 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc60Q8C4J0 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc60Q8C4J0 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc60Q8C4J0 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc60Q8C4J0 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc60Q8C4J0 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc60Q8C4J0 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc60Q8C4J0 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc60Q8C4J0 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc60Q8C4J0 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc60Q8C4J0 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc60Q8C4J0 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc60Q8C4J0 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc60Q8C4J0 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc60Q8C4J0 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc60Q8C4J0 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc60Q8C4J0 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc60Q8C4J0 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc60Q8C4J0 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc60Q8C4J0 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc60Q8C4J0 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Ccdc60Q8C4J0 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Ccdc60Q8C4J0 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Ccdc60Q8C4J0 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc60Q8C4J0 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc60Q8C4J0 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc60Q8C4J0 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc60Q8C4J0 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc60Q8C4J0 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc60Q8C4J0 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc60Q8C4J0 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc60Q8C4J0 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc60Q8C4J0 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc60Q8C4J0 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc60Q8C4J0 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc60Q8C4J0 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc60Q8C4J0 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc60Q8C4J0 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc60Q8C4J0 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc60Q8C4J0 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc60Q8C4J0 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc60Q8C4J0 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc60Q8C4J0 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc60Q8C4J0 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc60Q8C4J0 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc60Q8C4J0 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc60Q8C4J0 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc60Q8C4J0 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc60Q8C4J0 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc60Q8C4J0 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc60Q8C4J0 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc60Q8C4J0 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc60Q8C4J0 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc60Q8C4J0 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc60Q8C4J0 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc60Q8C4J0 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc60Q8C4J0 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc60Q8C4J0 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc60Q8C4J0 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc60Q8C4J0 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc60Q8C4J0 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc60Q8C4J0 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc60Q8C4J0 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc60Q8C4J0 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc60Q8C4J0 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc60Q8C4J0 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc60Q8C4J0 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc60Q8C4J0 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc60Q8C4J0 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc60Q8C4J0 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc60Q8C4J0 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc60Q8C4J0 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc60Q8C4J0 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc60Q8C4J0 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc60Q8C4J0 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc60Q8C4J0 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc60Q8C4J0 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc60Q8C4J0 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc60Q8C4J0 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc60Q8C4J0 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc60Q8C4J0 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc60Q8C4J0 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccdc60Q8C4J0 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccdc60Q8C4J0 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccdc60Q8C4J0 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccdc60Q8C4J0 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccdc60Q8C4J0 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccdc60Q8C4J0 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccdc60Q8C4J0 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ccdc60Q8C4J0 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc60Q8C4J0 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc60Q8C4J0 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc60Q8C4J0 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc60Q8C4J0 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc60Q8C4J0 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc60Q8C4J0 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc60Q8C4J0 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc60Q8C4J0 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms