Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3D3

Gm5468, Predicted gene 5468, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5468Q8C3D3 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5468Q8C3D3 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5468Q8C3D3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5468Q8C3D3 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5468Q8C3D3 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5468Q8C3D3 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5468Q8C3D3 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5468Q8C3D3 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5468Q8C3D3 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5468Q8C3D3 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5468Q8C3D3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5468Q8C3D3 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5468Q8C3D3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5468Q8C3D3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5468Q8C3D3 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5468Q8C3D3 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5468Q8C3D3 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5468Q8C3D3 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5468Q8C3D3 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Gm5468Q8C3D3 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5468Q8C3D3 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5468Q8C3D3 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5468Q8C3D3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5468Q8C3D3 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5468Q8C3D3 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5468Q8C3D3 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5468Q8C3D3 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5468Q8C3D3 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5468Q8C3D3 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5468Q8C3D3 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5468Q8C3D3 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5468Q8C3D3 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5468Q8C3D3 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5468Q8C3D3 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5468Q8C3D3 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5468Q8C3D3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5468Q8C3D3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5468Q8C3D3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5468Q8C3D3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5468Q8C3D3 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5468Q8C3D3 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5468Q8C3D3 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5468Q8C3D3 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5468Q8C3D3 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5468Q8C3D3 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5468Q8C3D3 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5468Q8C3D3 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5468Q8C3D3 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5468Q8C3D3 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5468Q8C3D3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5468Q8C3D3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5468Q8C3D3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5468Q8C3D3 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5468Q8C3D3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5468Q8C3D3 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5468Q8C3D3 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5468Q8C3D3 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5468Q8C3D3 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5468Q8C3D3 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5468Q8C3D3 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5468Q8C3D3 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5468Q8C3D3 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5468Q8C3D3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5468Q8C3D3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5468Q8C3D3 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5468Q8C3D3 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5468Q8C3D3 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5468Q8C3D3 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5468Q8C3D3 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5468Q8C3D3 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Gm5468Q8C3D3 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5468Q8C3D3 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5468Q8C3D3 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5468Q8C3D3 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5468Q8C3D3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5468Q8C3D3 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5468Q8C3D3 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5468Q8C3D3 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5468Q8C3D3 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5468Q8C3D3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5468Q8C3D3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5468Q8C3D3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5468Q8C3D3 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5468Q8C3D3 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5468Q8C3D3 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5468Q8C3D3 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5468Q8C3D3 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5468Q8C3D3 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm5468Q8C3D3 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm5468Q8C3D3 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm5468Q8C3D3 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5468Q8C3D3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5468Q8C3D3 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5468Q8C3D3 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5468Q8C3D3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5468Q8C3D3 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5468Q8C3D3 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5468Q8C3D3 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5468Q8C3D3 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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