Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0Q9

Rapgef5, Rap guanine nucleotide exchange factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 814 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef5Q8C0Q9 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rapgef5Q8C0Q9 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rapgef5Q8C0Q9 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rapgef5Q8C0Q9 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rapgef5Q8C0Q9 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rapgef5Q8C0Q9 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rapgef5Q8C0Q9 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rapgef5Q8C0Q9 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rapgef5Q8C0Q9 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rapgef5Q8C0Q9 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rapgef5Q8C0Q9 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Rapgef5Q8C0Q9 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rapgef5Q8C0Q9 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rapgef5Q8C0Q9 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rapgef5Q8C0Q9 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rapgef5Q8C0Q9 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rapgef5Q8C0Q9 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rapgef5Q8C0Q9 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rapgef5Q8C0Q9 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rapgef5Q8C0Q9 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rapgef5Q8C0Q9 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rapgef5Q8C0Q9 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rapgef5Q8C0Q9 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rapgef5Q8C0Q9 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rapgef5Q8C0Q9 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rapgef5Q8C0Q9 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rapgef5Q8C0Q9 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rapgef5Q8C0Q9 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rapgef5Q8C0Q9 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Rapgef5Q8C0Q9 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Rapgef5Q8C0Q9 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rapgef5Q8C0Q9 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rapgef5Q8C0Q9 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rapgef5Q8C0Q9 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rapgef5Q8C0Q9 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rapgef5Q8C0Q9 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rapgef5Q8C0Q9 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rapgef5Q8C0Q9 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rapgef5Q8C0Q9 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rapgef5Q8C0Q9 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rapgef5Q8C0Q9 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rapgef5Q8C0Q9 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rapgef5Q8C0Q9 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rapgef5Q8C0Q9 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rapgef5Q8C0Q9 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rapgef5Q8C0Q9 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rapgef5Q8C0Q9 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rapgef5Q8C0Q9 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rapgef5Q8C0Q9 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rapgef5Q8C0Q9 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rapgef5Q8C0Q9 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rapgef5Q8C0Q9 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rapgef5Q8C0Q9 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rapgef5Q8C0Q9 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rapgef5Q8C0Q9 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rapgef5Q8C0Q9 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rapgef5Q8C0Q9 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rapgef5Q8C0Q9 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rapgef5Q8C0Q9 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rapgef5Q8C0Q9 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rapgef5Q8C0Q9 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Rapgef5Q8C0Q9 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rapgef5Q8C0Q9 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rapgef5Q8C0Q9 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Rapgef5Q8C0Q9 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Rapgef5Q8C0Q9 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rapgef5Q8C0Q9 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Rapgef5Q8C0Q9 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rapgef5Q8C0Q9 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rapgef5Q8C0Q9 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rapgef5Q8C0Q9 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rapgef5Q8C0Q9 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rapgef5Q8C0Q9 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rapgef5Q8C0Q9 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rapgef5Q8C0Q9 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rapgef5Q8C0Q9 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rapgef5Q8C0Q9 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Rapgef5Q8C0Q9 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rapgef5Q8C0Q9 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rapgef5Q8C0Q9 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rapgef5Q8C0Q9 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rapgef5Q8C0Q9 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rapgef5Q8C0Q9 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rapgef5Q8C0Q9 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rapgef5Q8C0Q9 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rapgef5Q8C0Q9 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rapgef5Q8C0Q9 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rapgef5Q8C0Q9 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rapgef5Q8C0Q9 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rapgef5Q8C0Q9 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rapgef5Q8C0Q9 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rapgef5Q8C0Q9 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rapgef5Q8C0Q9 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rapgef5Q8C0Q9 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rapgef5Q8C0Q9 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rapgef5Q8C0Q9 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rapgef5Q8C0Q9 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rapgef5Q8C0Q9 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rapgef5Q8C0Q9 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rapgef5Q8C0Q9 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms