Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atg16l1Q8C0J2 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atg16l1Q8C0J2 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atg16l1Q8C0J2 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atg16l1Q8C0J2 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atg16l1Q8C0J2 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atg16l1Q8C0J2 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atg16l1Q8C0J2 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atg16l1Q8C0J2 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atg16l1Q8C0J2 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atg16l1Q8C0J2 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atg16l1Q8C0J2 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atg16l1Q8C0J2 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atg16l1Q8C0J2 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atg16l1Q8C0J2 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atg16l1Q8C0J2 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atg16l1Q8C0J2 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atg16l1Q8C0J2 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atg16l1Q8C0J2 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atg16l1Q8C0J2 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atg16l1Q8C0J2 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atg16l1Q8C0J2 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atg16l1Q8C0J2 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atg16l1Q8C0J2 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atg16l1Q8C0J2 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atg16l1Q8C0J2 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atg16l1Q8C0J2 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atg16l1Q8C0J2 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atg16l1Q8C0J2 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atg16l1Q8C0J2 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atg16l1Q8C0J2 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atg16l1Q8C0J2 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Atg16l1Q8C0J2 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atg16l1Q8C0J2 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atg16l1Q8C0J2 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atg16l1Q8C0J2 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atg16l1Q8C0J2 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atg16l1Q8C0J2 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atg16l1Q8C0J2 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atg16l1Q8C0J2 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atg16l1Q8C0J2 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atg16l1Q8C0J2 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atg16l1Q8C0J2 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atg16l1Q8C0J2 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atg16l1Q8C0J2 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atg16l1Q8C0J2 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atg16l1Q8C0J2 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atg16l1Q8C0J2 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atg16l1Q8C0J2 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atg16l1Q8C0J2 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atg16l1Q8C0J2 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atg16l1Q8C0J2 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atg16l1Q8C0J2 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atg16l1Q8C0J2 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atg16l1Q8C0J2 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atg16l1Q8C0J2 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atg16l1Q8C0J2 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atg16l1Q8C0J2 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atg16l1Q8C0J2 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atg16l1Q8C0J2 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atg16l1Q8C0J2 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atg16l1Q8C0J2 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atg16l1Q8C0J2 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atg16l1Q8C0J2 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atg16l1Q8C0J2 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atg16l1Q8C0J2 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atg16l1Q8C0J2 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atg16l1Q8C0J2 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atg16l1Q8C0J2 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atg16l1Q8C0J2 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atg16l1Q8C0J2 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atg16l1Q8C0J2 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atg16l1Q8C0J2 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atg16l1Q8C0J2 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atg16l1Q8C0J2 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atg16l1Q8C0J2 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atg16l1Q8C0J2 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atg16l1Q8C0J2 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atg16l1Q8C0J2 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atg16l1Q8C0J2 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atg16l1Q8C0J2 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atg16l1Q8C0J2 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atg16l1Q8C0J2 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atg16l1Q8C0J2 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atg16l1Q8C0J2 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atg16l1Q8C0J2 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atg16l1Q8C0J2 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atg16l1Q8C0J2 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atg16l1Q8C0J2 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atg16l1Q8C0J2 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atg16l1Q8C0J2 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atg16l1Q8C0J2 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atg16l1Q8C0J2 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atg16l1Q8C0J2 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atg16l1Q8C0J2 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atg16l1Q8C0J2 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atg16l1Q8C0J2 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atg16l1Q8C0J2 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atg16l1Q8C0J2 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Atg16l1Q8C0J2 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms