Protein–RNA interactions for Protein: Q8C079

Strip1, Striatin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Strip1Q8C079 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Strip1Q8C079 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Strip1Q8C079 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Strip1Q8C079 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Strip1Q8C079 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Strip1Q8C079 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Strip1Q8C079 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Strip1Q8C079 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Strip1Q8C079 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Strip1Q8C079 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Strip1Q8C079 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Strip1Q8C079 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Strip1Q8C079 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Strip1Q8C079 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Strip1Q8C079 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Strip1Q8C079 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Strip1Q8C079 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Strip1Q8C079 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Strip1Q8C079 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Strip1Q8C079 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Strip1Q8C079 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Strip1Q8C079 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Strip1Q8C079 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Strip1Q8C079 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Strip1Q8C079 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Strip1Q8C079 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Strip1Q8C079 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Strip1Q8C079 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Strip1Q8C079 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Strip1Q8C079 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Strip1Q8C079 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Strip1Q8C079 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Strip1Q8C079 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Strip1Q8C079 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Strip1Q8C079 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Strip1Q8C079 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Strip1Q8C079 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Strip1Q8C079 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Strip1Q8C079 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Strip1Q8C079 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Strip1Q8C079 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Strip1Q8C079 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Strip1Q8C079 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Strip1Q8C079 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Strip1Q8C079 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Strip1Q8C079 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Strip1Q8C079 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Strip1Q8C079 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Strip1Q8C079 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Strip1Q8C079 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Strip1Q8C079 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Strip1Q8C079 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Strip1Q8C079 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Strip1Q8C079 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Strip1Q8C079 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Strip1Q8C079 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Strip1Q8C079 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Strip1Q8C079 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Strip1Q8C079 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Strip1Q8C079 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Strip1Q8C079 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Strip1Q8C079 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Strip1Q8C079 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Strip1Q8C079 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Strip1Q8C079 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Strip1Q8C079 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Strip1Q8C079 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Strip1Q8C079 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Strip1Q8C079 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Strip1Q8C079 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Strip1Q8C079 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Strip1Q8C079 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Strip1Q8C079 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Strip1Q8C079 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Strip1Q8C079 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Strip1Q8C079 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Strip1Q8C079 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Strip1Q8C079 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Strip1Q8C079 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Strip1Q8C079 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Strip1Q8C079 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Strip1Q8C079 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Strip1Q8C079 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Strip1Q8C079 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Strip1Q8C079 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Strip1Q8C079 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Strip1Q8C079 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Strip1Q8C079 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Strip1Q8C079 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Strip1Q8C079 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Strip1Q8C079 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Strip1Q8C079 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Strip1Q8C079 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Strip1Q8C079 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Strip1Q8C079 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Strip1Q8C079 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Strip1Q8C079 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Strip1Q8C079 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Strip1Q8C079 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Strip1Q8C079 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms