Protein–RNA interactions for Protein: Q8BYI9

Tnr, Tenascin-R, mousemouse

Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnrQ8BYI9 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TnrQ8BYI9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TnrQ8BYI9 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TnrQ8BYI9 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TnrQ8BYI9 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TnrQ8BYI9 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TnrQ8BYI9 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TnrQ8BYI9 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TnrQ8BYI9 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TnrQ8BYI9 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TnrQ8BYI9 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TnrQ8BYI9 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TnrQ8BYI9 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TnrQ8BYI9 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TnrQ8BYI9 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TnrQ8BYI9 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TnrQ8BYI9 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TnrQ8BYI9 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TnrQ8BYI9 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TnrQ8BYI9 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
TnrQ8BYI9 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TnrQ8BYI9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TnrQ8BYI9 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
TnrQ8BYI9 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC26.83■■□□□ 1.88
TnrQ8BYI9 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
TnrQ8BYI9 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TnrQ8BYI9 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TnrQ8BYI9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TnrQ8BYI9 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TnrQ8BYI9 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TnrQ8BYI9 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TnrQ8BYI9 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TnrQ8BYI9 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TnrQ8BYI9 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
TnrQ8BYI9 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TnrQ8BYI9 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TnrQ8BYI9 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TnrQ8BYI9 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TnrQ8BYI9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TnrQ8BYI9 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TnrQ8BYI9 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TnrQ8BYI9 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TnrQ8BYI9 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TnrQ8BYI9 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TnrQ8BYI9 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TnrQ8BYI9 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TnrQ8BYI9 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
TnrQ8BYI9 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TnrQ8BYI9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TnrQ8BYI9 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TnrQ8BYI9 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TnrQ8BYI9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TnrQ8BYI9 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
TnrQ8BYI9 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TnrQ8BYI9 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TnrQ8BYI9 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TnrQ8BYI9 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TnrQ8BYI9 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TnrQ8BYI9 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TnrQ8BYI9 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TnrQ8BYI9 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TnrQ8BYI9 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TnrQ8BYI9 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TnrQ8BYI9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TnrQ8BYI9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TnrQ8BYI9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TnrQ8BYI9 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TnrQ8BYI9 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TnrQ8BYI9 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TnrQ8BYI9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TnrQ8BYI9 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TnrQ8BYI9 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
TnrQ8BYI9 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TnrQ8BYI9 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TnrQ8BYI9 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TnrQ8BYI9 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TnrQ8BYI9 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TnrQ8BYI9 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TnrQ8BYI9 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TnrQ8BYI9 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TnrQ8BYI9 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TnrQ8BYI9 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TnrQ8BYI9 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TnrQ8BYI9 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TnrQ8BYI9 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TnrQ8BYI9 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TnrQ8BYI9 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TnrQ8BYI9 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TnrQ8BYI9 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TnrQ8BYI9 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TnrQ8BYI9 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TnrQ8BYI9 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TnrQ8BYI9 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TnrQ8BYI9 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TnrQ8BYI9 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TnrQ8BYI9 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TnrQ8BYI9 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TnrQ8BYI9 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TnrQ8BYI9 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TnrQ8BYI9 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms