Protein–RNA interactions for Protein: Q8BY87

Usp47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, mousemouse

Predictions only

Length 1,376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp47Q8BY87 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Usp47Q8BY87 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Usp47Q8BY87 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Usp47Q8BY87 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Usp47Q8BY87 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Usp47Q8BY87 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Usp47Q8BY87 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Usp47Q8BY87 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Usp47Q8BY87 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Usp47Q8BY87 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Usp47Q8BY87 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Usp47Q8BY87 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Usp47Q8BY87 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Usp47Q8BY87 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Usp47Q8BY87 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Usp47Q8BY87 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Usp47Q8BY87 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Usp47Q8BY87 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Usp47Q8BY87 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Usp47Q8BY87 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Usp47Q8BY87 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Usp47Q8BY87 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Usp47Q8BY87 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Usp47Q8BY87 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Usp47Q8BY87 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Usp47Q8BY87 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Usp47Q8BY87 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Usp47Q8BY87 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Usp47Q8BY87 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Usp47Q8BY87 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
Usp47Q8BY87 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Usp47Q8BY87 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Usp47Q8BY87 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Usp47Q8BY87 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Usp47Q8BY87 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Usp47Q8BY87 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Usp47Q8BY87 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Usp47Q8BY87 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Usp47Q8BY87 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Usp47Q8BY87 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Usp47Q8BY87 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Usp47Q8BY87 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Usp47Q8BY87 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Usp47Q8BY87 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Usp47Q8BY87 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Usp47Q8BY87 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Usp47Q8BY87 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Usp47Q8BY87 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Usp47Q8BY87 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Usp47Q8BY87 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Usp47Q8BY87 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Usp47Q8BY87 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Usp47Q8BY87 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
Usp47Q8BY87 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Usp47Q8BY87 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Usp47Q8BY87 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Usp47Q8BY87 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Usp47Q8BY87 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Usp47Q8BY87 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Usp47Q8BY87 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Usp47Q8BY87 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Usp47Q8BY87 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Usp47Q8BY87 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Usp47Q8BY87 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Usp47Q8BY87 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Usp47Q8BY87 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Usp47Q8BY87 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Usp47Q8BY87 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Usp47Q8BY87 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Usp47Q8BY87 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Usp47Q8BY87 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Usp47Q8BY87 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Usp47Q8BY87 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Usp47Q8BY87 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Usp47Q8BY87 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Usp47Q8BY87 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Usp47Q8BY87 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Usp47Q8BY87 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Usp47Q8BY87 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Usp47Q8BY87 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Usp47Q8BY87 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Usp47Q8BY87 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Usp47Q8BY87 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Usp47Q8BY87 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Usp47Q8BY87 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Usp47Q8BY87 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Usp47Q8BY87 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Usp47Q8BY87 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Usp47Q8BY87 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Usp47Q8BY87 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Usp47Q8BY87 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Usp47Q8BY87 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Usp47Q8BY87 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Usp47Q8BY87 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Usp47Q8BY87 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Usp47Q8BY87 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Usp47Q8BY87 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Usp47Q8BY87 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Usp47Q8BY87 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Usp47Q8BY87 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms