Protein–RNA interactions for Protein: Q8BY02

Nkrf, NF-kappa-B-repressing factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NkrfQ8BY02 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NkrfQ8BY02 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NkrfQ8BY02 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NkrfQ8BY02 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NkrfQ8BY02 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NkrfQ8BY02 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NkrfQ8BY02 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NkrfQ8BY02 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NkrfQ8BY02 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NkrfQ8BY02 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NkrfQ8BY02 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NkrfQ8BY02 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NkrfQ8BY02 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NkrfQ8BY02 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NkrfQ8BY02 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NkrfQ8BY02 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NkrfQ8BY02 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NkrfQ8BY02 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NkrfQ8BY02 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NkrfQ8BY02 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NkrfQ8BY02 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NkrfQ8BY02 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NkrfQ8BY02 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NkrfQ8BY02 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NkrfQ8BY02 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NkrfQ8BY02 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NkrfQ8BY02 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NkrfQ8BY02 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NkrfQ8BY02 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NkrfQ8BY02 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NkrfQ8BY02 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NkrfQ8BY02 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NkrfQ8BY02 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NkrfQ8BY02 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NkrfQ8BY02 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NkrfQ8BY02 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NkrfQ8BY02 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NkrfQ8BY02 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NkrfQ8BY02 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NkrfQ8BY02 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NkrfQ8BY02 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NkrfQ8BY02 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NkrfQ8BY02 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NkrfQ8BY02 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
NkrfQ8BY02 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NkrfQ8BY02 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NkrfQ8BY02 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NkrfQ8BY02 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NkrfQ8BY02 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NkrfQ8BY02 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NkrfQ8BY02 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NkrfQ8BY02 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NkrfQ8BY02 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NkrfQ8BY02 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NkrfQ8BY02 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NkrfQ8BY02 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NkrfQ8BY02 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NkrfQ8BY02 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NkrfQ8BY02 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NkrfQ8BY02 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NkrfQ8BY02 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NkrfQ8BY02 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NkrfQ8BY02 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NkrfQ8BY02 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NkrfQ8BY02 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NkrfQ8BY02 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NkrfQ8BY02 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NkrfQ8BY02 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NkrfQ8BY02 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NkrfQ8BY02 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NkrfQ8BY02 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NkrfQ8BY02 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NkrfQ8BY02 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NkrfQ8BY02 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NkrfQ8BY02 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NkrfQ8BY02 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NkrfQ8BY02 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NkrfQ8BY02 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NkrfQ8BY02 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NkrfQ8BY02 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NkrfQ8BY02 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NkrfQ8BY02 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NkrfQ8BY02 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NkrfQ8BY02 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NkrfQ8BY02 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NkrfQ8BY02 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NkrfQ8BY02 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NkrfQ8BY02 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
NkrfQ8BY02 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
NkrfQ8BY02 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NkrfQ8BY02 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NkrfQ8BY02 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NkrfQ8BY02 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NkrfQ8BY02 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NkrfQ8BY02 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NkrfQ8BY02 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NkrfQ8BY02 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NkrfQ8BY02 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NkrfQ8BY02 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NkrfQ8BY02 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms