Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXX9

Ccdc169, Coiled-coil domain-containing protein 169, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc169Q8BXX9 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc169Q8BXX9 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc169Q8BXX9 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc169Q8BXX9 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc169Q8BXX9 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc169Q8BXX9 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc169Q8BXX9 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc169Q8BXX9 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc169Q8BXX9 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc169Q8BXX9 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc169Q8BXX9 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc169Q8BXX9 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc169Q8BXX9 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc169Q8BXX9 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc169Q8BXX9 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc169Q8BXX9 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc169Q8BXX9 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc169Q8BXX9 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc169Q8BXX9 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc169Q8BXX9 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc169Q8BXX9 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc169Q8BXX9 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc169Q8BXX9 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc169Q8BXX9 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc169Q8BXX9 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc169Q8BXX9 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc169Q8BXX9 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc169Q8BXX9 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc169Q8BXX9 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc169Q8BXX9 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc169Q8BXX9 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc169Q8BXX9 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc169Q8BXX9 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc169Q8BXX9 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc169Q8BXX9 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc169Q8BXX9 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc169Q8BXX9 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc169Q8BXX9 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc169Q8BXX9 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc169Q8BXX9 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc169Q8BXX9 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc169Q8BXX9 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc169Q8BXX9 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc169Q8BXX9 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc169Q8BXX9 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc169Q8BXX9 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc169Q8BXX9 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc169Q8BXX9 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc169Q8BXX9 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc169Q8BXX9 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc169Q8BXX9 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc169Q8BXX9 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc169Q8BXX9 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc169Q8BXX9 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc169Q8BXX9 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc169Q8BXX9 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc169Q8BXX9 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc169Q8BXX9 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc169Q8BXX9 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc169Q8BXX9 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc169Q8BXX9 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc169Q8BXX9 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc169Q8BXX9 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc169Q8BXX9 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc169Q8BXX9 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc169Q8BXX9 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc169Q8BXX9 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc169Q8BXX9 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc169Q8BXX9 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc169Q8BXX9 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc169Q8BXX9 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc169Q8BXX9 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc169Q8BXX9 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc169Q8BXX9 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc169Q8BXX9 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc169Q8BXX9 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc169Q8BXX9 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc169Q8BXX9 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc169Q8BXX9 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc169Q8BXX9 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc169Q8BXX9 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc169Q8BXX9 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc169Q8BXX9 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc169Q8BXX9 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc169Q8BXX9 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc169Q8BXX9 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc169Q8BXX9 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc169Q8BXX9 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc169Q8BXX9 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc169Q8BXX9 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc169Q8BXX9 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc169Q8BXX9 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc169Q8BXX9 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc169Q8BXX9 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc169Q8BXX9 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc169Q8BXX9 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc169Q8BXX9 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc169Q8BXX9 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc169Q8BXX9 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ccdc169Q8BXX9 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms