Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX32

Slx1b, Structure-specific endonuclease subunit SLX1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx1bQ8BX32 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Slx1bQ8BX32 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Slx1bQ8BX32 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Slx1bQ8BX32 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Slx1bQ8BX32 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Slx1bQ8BX32 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Slx1bQ8BX32 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Slx1bQ8BX32 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Slx1bQ8BX32 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Slx1bQ8BX32 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Slx1bQ8BX32 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Slx1bQ8BX32 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Slx1bQ8BX32 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Slx1bQ8BX32 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Slx1bQ8BX32 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Slx1bQ8BX32 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Slx1bQ8BX32 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Slx1bQ8BX32 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Slx1bQ8BX32 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Slx1bQ8BX32 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Slx1bQ8BX32 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Slx1bQ8BX32 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Slx1bQ8BX32 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Slx1bQ8BX32 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Slx1bQ8BX32 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Slx1bQ8BX32 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Slx1bQ8BX32 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Slx1bQ8BX32 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Slx1bQ8BX32 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Slx1bQ8BX32 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Slx1bQ8BX32 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Slx1bQ8BX32 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Slx1bQ8BX32 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Slx1bQ8BX32 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Slx1bQ8BX32 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Slx1bQ8BX32 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Slx1bQ8BX32 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Slx1bQ8BX32 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Slx1bQ8BX32 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Slx1bQ8BX32 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Slx1bQ8BX32 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Slx1bQ8BX32 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Slx1bQ8BX32 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Slx1bQ8BX32 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Slx1bQ8BX32 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Slx1bQ8BX32 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Slx1bQ8BX32 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Slx1bQ8BX32 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Slx1bQ8BX32 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Slx1bQ8BX32 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Slx1bQ8BX32 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Slx1bQ8BX32 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Slx1bQ8BX32 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Slx1bQ8BX32 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Slx1bQ8BX32 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Slx1bQ8BX32 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Slx1bQ8BX32 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Slx1bQ8BX32 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Slx1bQ8BX32 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Slx1bQ8BX32 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Slx1bQ8BX32 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Slx1bQ8BX32 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Slx1bQ8BX32 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Slx1bQ8BX32 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Slx1bQ8BX32 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Slx1bQ8BX32 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Slx1bQ8BX32 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Slx1bQ8BX32 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Slx1bQ8BX32 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Slx1bQ8BX32 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Slx1bQ8BX32 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Slx1bQ8BX32 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Slx1bQ8BX32 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Slx1bQ8BX32 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Slx1bQ8BX32 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Slx1bQ8BX32 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Slx1bQ8BX32 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Slx1bQ8BX32 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Slx1bQ8BX32 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Slx1bQ8BX32 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Slx1bQ8BX32 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Slx1bQ8BX32 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Slx1bQ8BX32 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Slx1bQ8BX32 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Slx1bQ8BX32 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Slx1bQ8BX32 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Slx1bQ8BX32 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Slx1bQ8BX32 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Slx1bQ8BX32 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Slx1bQ8BX32 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Slx1bQ8BX32 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Slx1bQ8BX32 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Slx1bQ8BX32 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Slx1bQ8BX32 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Slx1bQ8BX32 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Slx1bQ8BX32 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Slx1bQ8BX32 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Slx1bQ8BX32 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Slx1bQ8BX32 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Slx1bQ8BX32 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms