Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVP1

Triml1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIML1, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Triml1Q8BVP1 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Triml1Q8BVP1 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Triml1Q8BVP1 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Triml1Q8BVP1 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Triml1Q8BVP1 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Triml1Q8BVP1 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Triml1Q8BVP1 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Triml1Q8BVP1 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Triml1Q8BVP1 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Triml1Q8BVP1 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Triml1Q8BVP1 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Triml1Q8BVP1 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Triml1Q8BVP1 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Triml1Q8BVP1 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Triml1Q8BVP1 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Triml1Q8BVP1 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Triml1Q8BVP1 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Triml1Q8BVP1 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Triml1Q8BVP1 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Triml1Q8BVP1 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Triml1Q8BVP1 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Triml1Q8BVP1 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Triml1Q8BVP1 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Triml1Q8BVP1 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Triml1Q8BVP1 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Triml1Q8BVP1 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Triml1Q8BVP1 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Triml1Q8BVP1 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Triml1Q8BVP1 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Triml1Q8BVP1 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Triml1Q8BVP1 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Triml1Q8BVP1 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Triml1Q8BVP1 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Triml1Q8BVP1 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Triml1Q8BVP1 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Triml1Q8BVP1 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Triml1Q8BVP1 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Triml1Q8BVP1 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Triml1Q8BVP1 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Triml1Q8BVP1 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Triml1Q8BVP1 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Triml1Q8BVP1 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Triml1Q8BVP1 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Triml1Q8BVP1 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Triml1Q8BVP1 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Triml1Q8BVP1 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Triml1Q8BVP1 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Triml1Q8BVP1 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Triml1Q8BVP1 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Triml1Q8BVP1 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Triml1Q8BVP1 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Triml1Q8BVP1 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Triml1Q8BVP1 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Triml1Q8BVP1 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Triml1Q8BVP1 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Triml1Q8BVP1 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Triml1Q8BVP1 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Triml1Q8BVP1 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Triml1Q8BVP1 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Triml1Q8BVP1 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Triml1Q8BVP1 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Triml1Q8BVP1 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Triml1Q8BVP1 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Triml1Q8BVP1 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Triml1Q8BVP1 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Triml1Q8BVP1 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Triml1Q8BVP1 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Triml1Q8BVP1 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Triml1Q8BVP1 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Triml1Q8BVP1 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Triml1Q8BVP1 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Triml1Q8BVP1 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Triml1Q8BVP1 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Triml1Q8BVP1 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Triml1Q8BVP1 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Triml1Q8BVP1 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Triml1Q8BVP1 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Triml1Q8BVP1 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Triml1Q8BVP1 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Triml1Q8BVP1 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Triml1Q8BVP1 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Triml1Q8BVP1 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Triml1Q8BVP1 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Triml1Q8BVP1 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Triml1Q8BVP1 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Triml1Q8BVP1 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Triml1Q8BVP1 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Triml1Q8BVP1 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Triml1Q8BVP1 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Triml1Q8BVP1 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Triml1Q8BVP1 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Triml1Q8BVP1 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Triml1Q8BVP1 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Triml1Q8BVP1 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Triml1Q8BVP1 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Triml1Q8BVP1 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Triml1Q8BVP1 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Triml1Q8BVP1 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Triml1Q8BVP1 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Triml1Q8BVP1 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 158.9 ms