Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVA4

Lmod1, Leiomodin-1, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod1Q8BVA4 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lmod1Q8BVA4 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lmod1Q8BVA4 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lmod1Q8BVA4 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lmod1Q8BVA4 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lmod1Q8BVA4 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lmod1Q8BVA4 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lmod1Q8BVA4 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lmod1Q8BVA4 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lmod1Q8BVA4 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lmod1Q8BVA4 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lmod1Q8BVA4 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lmod1Q8BVA4 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lmod1Q8BVA4 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lmod1Q8BVA4 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lmod1Q8BVA4 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lmod1Q8BVA4 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lmod1Q8BVA4 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lmod1Q8BVA4 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Lmod1Q8BVA4 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lmod1Q8BVA4 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lmod1Q8BVA4 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lmod1Q8BVA4 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lmod1Q8BVA4 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lmod1Q8BVA4 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lmod1Q8BVA4 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lmod1Q8BVA4 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lmod1Q8BVA4 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lmod1Q8BVA4 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lmod1Q8BVA4 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lmod1Q8BVA4 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lmod1Q8BVA4 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lmod1Q8BVA4 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lmod1Q8BVA4 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lmod1Q8BVA4 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lmod1Q8BVA4 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lmod1Q8BVA4 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lmod1Q8BVA4 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lmod1Q8BVA4 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lmod1Q8BVA4 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lmod1Q8BVA4 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lmod1Q8BVA4 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lmod1Q8BVA4 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lmod1Q8BVA4 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Lmod1Q8BVA4 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Lmod1Q8BVA4 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lmod1Q8BVA4 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lmod1Q8BVA4 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lmod1Q8BVA4 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lmod1Q8BVA4 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lmod1Q8BVA4 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lmod1Q8BVA4 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lmod1Q8BVA4 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lmod1Q8BVA4 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lmod1Q8BVA4 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lmod1Q8BVA4 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lmod1Q8BVA4 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lmod1Q8BVA4 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lmod1Q8BVA4 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lmod1Q8BVA4 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lmod1Q8BVA4 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lmod1Q8BVA4 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lmod1Q8BVA4 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lmod1Q8BVA4 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lmod1Q8BVA4 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lmod1Q8BVA4 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lmod1Q8BVA4 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lmod1Q8BVA4 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lmod1Q8BVA4 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lmod1Q8BVA4 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lmod1Q8BVA4 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lmod1Q8BVA4 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lmod1Q8BVA4 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lmod1Q8BVA4 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lmod1Q8BVA4 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lmod1Q8BVA4 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lmod1Q8BVA4 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lmod1Q8BVA4 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lmod1Q8BVA4 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lmod1Q8BVA4 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lmod1Q8BVA4 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Lmod1Q8BVA4 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Lmod1Q8BVA4 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Lmod1Q8BVA4 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Lmod1Q8BVA4 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Lmod1Q8BVA4 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lmod1Q8BVA4 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lmod1Q8BVA4 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Lmod1Q8BVA4 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lmod1Q8BVA4 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lmod1Q8BVA4 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lmod1Q8BVA4 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lmod1Q8BVA4 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lmod1Q8BVA4 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lmod1Q8BVA4 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Lmod1Q8BVA4 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Lmod1Q8BVA4 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lmod1Q8BVA4 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Lmod1Q8BVA4 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lmod1Q8BVA4 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms