Protein–RNA interactions for Protein: Q8BU27

Ppm1m, Protein phosphatase 1M, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppm1mQ8BU27 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ppm1mQ8BU27 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ppm1mQ8BU27 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ppm1mQ8BU27 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ppm1mQ8BU27 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ppm1mQ8BU27 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ppm1mQ8BU27 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ppm1mQ8BU27 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ppm1mQ8BU27 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ppm1mQ8BU27 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ppm1mQ8BU27 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ppm1mQ8BU27 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ppm1mQ8BU27 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ppm1mQ8BU27 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Ppm1mQ8BU27 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ppm1mQ8BU27 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ppm1mQ8BU27 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ppm1mQ8BU27 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ppm1mQ8BU27 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ppm1mQ8BU27 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ppm1mQ8BU27 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ppm1mQ8BU27 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Ppm1mQ8BU27 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Ppm1mQ8BU27 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ppm1mQ8BU27 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ppm1mQ8BU27 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Ppm1mQ8BU27 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ppm1mQ8BU27 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ppm1mQ8BU27 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ppm1mQ8BU27 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ppm1mQ8BU27 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ppm1mQ8BU27 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ppm1mQ8BU27 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ppm1mQ8BU27 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ppm1mQ8BU27 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ppm1mQ8BU27 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ppm1mQ8BU27 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ppm1mQ8BU27 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ppm1mQ8BU27 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ppm1mQ8BU27 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ppm1mQ8BU27 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ppm1mQ8BU27 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ppm1mQ8BU27 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ppm1mQ8BU27 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ppm1mQ8BU27 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ppm1mQ8BU27 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ppm1mQ8BU27 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ppm1mQ8BU27 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ppm1mQ8BU27 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ppm1mQ8BU27 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ppm1mQ8BU27 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ppm1mQ8BU27 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ppm1mQ8BU27 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ppm1mQ8BU27 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ppm1mQ8BU27 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ppm1mQ8BU27 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ppm1mQ8BU27 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ppm1mQ8BU27 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ppm1mQ8BU27 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ppm1mQ8BU27 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ppm1mQ8BU27 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Ppm1mQ8BU27 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ppm1mQ8BU27 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ppm1mQ8BU27 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ppm1mQ8BU27 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ppm1mQ8BU27 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ppm1mQ8BU27 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ppm1mQ8BU27 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ppm1mQ8BU27 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ppm1mQ8BU27 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ppm1mQ8BU27 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ppm1mQ8BU27 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ppm1mQ8BU27 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ppm1mQ8BU27 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ppm1mQ8BU27 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ppm1mQ8BU27 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ppm1mQ8BU27 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ppm1mQ8BU27 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ppm1mQ8BU27 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ppm1mQ8BU27 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ppm1mQ8BU27 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ppm1mQ8BU27 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ppm1mQ8BU27 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Ppm1mQ8BU27 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ppm1mQ8BU27 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ppm1mQ8BU27 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ppm1mQ8BU27 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ppm1mQ8BU27 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ppm1mQ8BU27 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ppm1mQ8BU27 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ppm1mQ8BU27 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ppm1mQ8BU27 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ppm1mQ8BU27 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ppm1mQ8BU27 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ppm1mQ8BU27 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ppm1mQ8BU27 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ppm1mQ8BU27 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ppm1mQ8BU27 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ppm1mQ8BU27 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ppm1mQ8BU27 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms