Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSF5

Klhl38, Kelch-like protein 38, mousemouse

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl38Q8BSF5 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Klhl38Q8BSF5 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Klhl38Q8BSF5 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Klhl38Q8BSF5 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Klhl38Q8BSF5 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Klhl38Q8BSF5 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Klhl38Q8BSF5 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Klhl38Q8BSF5 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Klhl38Q8BSF5 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Klhl38Q8BSF5 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Klhl38Q8BSF5 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Klhl38Q8BSF5 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Klhl38Q8BSF5 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Klhl38Q8BSF5 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Klhl38Q8BSF5 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Klhl38Q8BSF5 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Klhl38Q8BSF5 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Klhl38Q8BSF5 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Klhl38Q8BSF5 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Klhl38Q8BSF5 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Klhl38Q8BSF5 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Klhl38Q8BSF5 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Klhl38Q8BSF5 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Klhl38Q8BSF5 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Klhl38Q8BSF5 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Klhl38Q8BSF5 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Klhl38Q8BSF5 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Klhl38Q8BSF5 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Klhl38Q8BSF5 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Klhl38Q8BSF5 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Klhl38Q8BSF5 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Klhl38Q8BSF5 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Klhl38Q8BSF5 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Klhl38Q8BSF5 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Klhl38Q8BSF5 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Klhl38Q8BSF5 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Klhl38Q8BSF5 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Klhl38Q8BSF5 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Klhl38Q8BSF5 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Klhl38Q8BSF5 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Klhl38Q8BSF5 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Klhl38Q8BSF5 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Klhl38Q8BSF5 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Klhl38Q8BSF5 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Klhl38Q8BSF5 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Klhl38Q8BSF5 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Klhl38Q8BSF5 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Klhl38Q8BSF5 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Klhl38Q8BSF5 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Klhl38Q8BSF5 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Klhl38Q8BSF5 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Klhl38Q8BSF5 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Klhl38Q8BSF5 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Klhl38Q8BSF5 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Klhl38Q8BSF5 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Klhl38Q8BSF5 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Klhl38Q8BSF5 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Klhl38Q8BSF5 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Klhl38Q8BSF5 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Klhl38Q8BSF5 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Klhl38Q8BSF5 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Klhl38Q8BSF5 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Klhl38Q8BSF5 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Klhl38Q8BSF5 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Klhl38Q8BSF5 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Klhl38Q8BSF5 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Klhl38Q8BSF5 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Klhl38Q8BSF5 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Klhl38Q8BSF5 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Klhl38Q8BSF5 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Klhl38Q8BSF5 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Klhl38Q8BSF5 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Klhl38Q8BSF5 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Klhl38Q8BSF5 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Klhl38Q8BSF5 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Klhl38Q8BSF5 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Klhl38Q8BSF5 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Klhl38Q8BSF5 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Klhl38Q8BSF5 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Klhl38Q8BSF5 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Klhl38Q8BSF5 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Klhl38Q8BSF5 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Klhl38Q8BSF5 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Klhl38Q8BSF5 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Klhl38Q8BSF5 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Klhl38Q8BSF5 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Klhl38Q8BSF5 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Klhl38Q8BSF5 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Klhl38Q8BSF5 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Klhl38Q8BSF5 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Klhl38Q8BSF5 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Klhl38Q8BSF5 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Klhl38Q8BSF5 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Klhl38Q8BSF5 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Klhl38Q8BSF5 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Klhl38Q8BSF5 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Klhl38Q8BSF5 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Klhl38Q8BSF5 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Klhl38Q8BSF5 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Klhl38Q8BSF5 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.1 ms