Protein–RNA interactions for Protein: Q8BRN9

Cc2d1b, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cc2d1bQ8BRN9 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cc2d1bQ8BRN9 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cc2d1bQ8BRN9 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cc2d1bQ8BRN9 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cc2d1bQ8BRN9 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cc2d1bQ8BRN9 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cc2d1bQ8BRN9 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cc2d1bQ8BRN9 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Cc2d1bQ8BRN9 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Cc2d1bQ8BRN9 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cc2d1bQ8BRN9 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cc2d1bQ8BRN9 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cc2d1bQ8BRN9 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cc2d1bQ8BRN9 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cc2d1bQ8BRN9 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Cc2d1bQ8BRN9 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cc2d1bQ8BRN9 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Cc2d1bQ8BRN9 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cc2d1bQ8BRN9 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cc2d1bQ8BRN9 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cc2d1bQ8BRN9 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cc2d1bQ8BRN9 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cc2d1bQ8BRN9 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cc2d1bQ8BRN9 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cc2d1bQ8BRN9 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cc2d1bQ8BRN9 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cc2d1bQ8BRN9 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cc2d1bQ8BRN9 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cc2d1bQ8BRN9 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cc2d1bQ8BRN9 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cc2d1bQ8BRN9 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cc2d1bQ8BRN9 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cc2d1bQ8BRN9 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cc2d1bQ8BRN9 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cc2d1bQ8BRN9 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cc2d1bQ8BRN9 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cc2d1bQ8BRN9 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cc2d1bQ8BRN9 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cc2d1bQ8BRN9 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cc2d1bQ8BRN9 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cc2d1bQ8BRN9 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cc2d1bQ8BRN9 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cc2d1bQ8BRN9 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cc2d1bQ8BRN9 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cc2d1bQ8BRN9 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cc2d1bQ8BRN9 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cc2d1bQ8BRN9 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cc2d1bQ8BRN9 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cc2d1bQ8BRN9 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cc2d1bQ8BRN9 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cc2d1bQ8BRN9 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cc2d1bQ8BRN9 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cc2d1bQ8BRN9 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cc2d1bQ8BRN9 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cc2d1bQ8BRN9 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cc2d1bQ8BRN9 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cc2d1bQ8BRN9 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cc2d1bQ8BRN9 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cc2d1bQ8BRN9 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cc2d1bQ8BRN9 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cc2d1bQ8BRN9 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cc2d1bQ8BRN9 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cc2d1bQ8BRN9 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cc2d1bQ8BRN9 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cc2d1bQ8BRN9 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cc2d1bQ8BRN9 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cc2d1bQ8BRN9 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cc2d1bQ8BRN9 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cc2d1bQ8BRN9 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cc2d1bQ8BRN9 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cc2d1bQ8BRN9 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cc2d1bQ8BRN9 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cc2d1bQ8BRN9 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cc2d1bQ8BRN9 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cc2d1bQ8BRN9 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Cc2d1bQ8BRN9 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Cc2d1bQ8BRN9 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cc2d1bQ8BRN9 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cc2d1bQ8BRN9 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cc2d1bQ8BRN9 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cc2d1bQ8BRN9 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Cc2d1bQ8BRN9 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Cc2d1bQ8BRN9 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cc2d1bQ8BRN9 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cc2d1bQ8BRN9 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cc2d1bQ8BRN9 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cc2d1bQ8BRN9 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cc2d1bQ8BRN9 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cc2d1bQ8BRN9 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cc2d1bQ8BRN9 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cc2d1bQ8BRN9 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cc2d1bQ8BRN9 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cc2d1bQ8BRN9 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cc2d1bQ8BRN9 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cc2d1bQ8BRN9 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cc2d1bQ8BRN9 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cc2d1bQ8BRN9 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cc2d1bQ8BRN9 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cc2d1bQ8BRN9 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cc2d1bQ8BRN9 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms