Protein–RNA interactions for Protein: Q8BR07

Bicd1, Protein bicaudal D homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 835 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bicd1Q8BR07 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Bicd1Q8BR07 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Bicd1Q8BR07 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Bicd1Q8BR07 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Bicd1Q8BR07 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Bicd1Q8BR07 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Bicd1Q8BR07 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Bicd1Q8BR07 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Bicd1Q8BR07 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Bicd1Q8BR07 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Bicd1Q8BR07 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Bicd1Q8BR07 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Bicd1Q8BR07 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Bicd1Q8BR07 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Bicd1Q8BR07 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Bicd1Q8BR07 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Bicd1Q8BR07 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Bicd1Q8BR07 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Bicd1Q8BR07 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Bicd1Q8BR07 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Bicd1Q8BR07 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Bicd1Q8BR07 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Bicd1Q8BR07 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Bicd1Q8BR07 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Bicd1Q8BR07 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Bicd1Q8BR07 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Bicd1Q8BR07 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Bicd1Q8BR07 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Bicd1Q8BR07 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Bicd1Q8BR07 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Bicd1Q8BR07 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Bicd1Q8BR07 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Bicd1Q8BR07 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Bicd1Q8BR07 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Bicd1Q8BR07 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Bicd1Q8BR07 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Bicd1Q8BR07 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Bicd1Q8BR07 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Bicd1Q8BR07 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Bicd1Q8BR07 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Bicd1Q8BR07 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Bicd1Q8BR07 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Bicd1Q8BR07 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Bicd1Q8BR07 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Bicd1Q8BR07 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Bicd1Q8BR07 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Bicd1Q8BR07 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Bicd1Q8BR07 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Bicd1Q8BR07 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Bicd1Q8BR07 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Bicd1Q8BR07 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Bicd1Q8BR07 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Bicd1Q8BR07 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Bicd1Q8BR07 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Bicd1Q8BR07 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Bicd1Q8BR07 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Bicd1Q8BR07 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Bicd1Q8BR07 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Bicd1Q8BR07 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Bicd1Q8BR07 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Bicd1Q8BR07 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Bicd1Q8BR07 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Bicd1Q8BR07 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Bicd1Q8BR07 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Bicd1Q8BR07 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Bicd1Q8BR07 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Bicd1Q8BR07 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Bicd1Q8BR07 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Bicd1Q8BR07 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Bicd1Q8BR07 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Bicd1Q8BR07 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Bicd1Q8BR07 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Bicd1Q8BR07 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Bicd1Q8BR07 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Bicd1Q8BR07 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Bicd1Q8BR07 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Bicd1Q8BR07 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Bicd1Q8BR07 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Bicd1Q8BR07 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Bicd1Q8BR07 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Bicd1Q8BR07 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Bicd1Q8BR07 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Bicd1Q8BR07 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Bicd1Q8BR07 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Bicd1Q8BR07 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Bicd1Q8BR07 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Bicd1Q8BR07 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Bicd1Q8BR07 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Bicd1Q8BR07 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Bicd1Q8BR07 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Bicd1Q8BR07 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Bicd1Q8BR07 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Bicd1Q8BR07 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Bicd1Q8BR07 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Bicd1Q8BR07 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Bicd1Q8BR07 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Bicd1Q8BR07 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Bicd1Q8BR07 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Bicd1Q8BR07 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Bicd1Q8BR07 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms