Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMJ8

Sp8, Transcription factor Sp8, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp8Q8BMJ8 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sp8Q8BMJ8 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sp8Q8BMJ8 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Sp8Q8BMJ8 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sp8Q8BMJ8 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sp8Q8BMJ8 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sp8Q8BMJ8 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sp8Q8BMJ8 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sp8Q8BMJ8 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sp8Q8BMJ8 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sp8Q8BMJ8 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sp8Q8BMJ8 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sp8Q8BMJ8 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sp8Q8BMJ8 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sp8Q8BMJ8 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sp8Q8BMJ8 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sp8Q8BMJ8 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sp8Q8BMJ8 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sp8Q8BMJ8 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Sp8Q8BMJ8 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sp8Q8BMJ8 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sp8Q8BMJ8 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sp8Q8BMJ8 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sp8Q8BMJ8 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sp8Q8BMJ8 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sp8Q8BMJ8 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Sp8Q8BMJ8 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sp8Q8BMJ8 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sp8Q8BMJ8 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sp8Q8BMJ8 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sp8Q8BMJ8 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sp8Q8BMJ8 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sp8Q8BMJ8 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sp8Q8BMJ8 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sp8Q8BMJ8 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sp8Q8BMJ8 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sp8Q8BMJ8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sp8Q8BMJ8 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sp8Q8BMJ8 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sp8Q8BMJ8 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sp8Q8BMJ8 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sp8Q8BMJ8 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sp8Q8BMJ8 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sp8Q8BMJ8 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Sp8Q8BMJ8 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sp8Q8BMJ8 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sp8Q8BMJ8 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sp8Q8BMJ8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sp8Q8BMJ8 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sp8Q8BMJ8 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sp8Q8BMJ8 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sp8Q8BMJ8 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sp8Q8BMJ8 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sp8Q8BMJ8 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sp8Q8BMJ8 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sp8Q8BMJ8 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sp8Q8BMJ8 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sp8Q8BMJ8 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sp8Q8BMJ8 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sp8Q8BMJ8 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sp8Q8BMJ8 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sp8Q8BMJ8 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sp8Q8BMJ8 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Sp8Q8BMJ8 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sp8Q8BMJ8 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sp8Q8BMJ8 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sp8Q8BMJ8 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sp8Q8BMJ8 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sp8Q8BMJ8 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sp8Q8BMJ8 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sp8Q8BMJ8 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sp8Q8BMJ8 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sp8Q8BMJ8 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sp8Q8BMJ8 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sp8Q8BMJ8 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sp8Q8BMJ8 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sp8Q8BMJ8 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sp8Q8BMJ8 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sp8Q8BMJ8 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sp8Q8BMJ8 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sp8Q8BMJ8 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sp8Q8BMJ8 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sp8Q8BMJ8 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sp8Q8BMJ8 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sp8Q8BMJ8 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Sp8Q8BMJ8 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sp8Q8BMJ8 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sp8Q8BMJ8 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sp8Q8BMJ8 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Sp8Q8BMJ8 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sp8Q8BMJ8 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sp8Q8BMJ8 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sp8Q8BMJ8 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sp8Q8BMJ8 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sp8Q8BMJ8 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sp8Q8BMJ8 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sp8Q8BMJ8 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sp8Q8BMJ8 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sp8Q8BMJ8 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sp8Q8BMJ8 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms