Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI0

Fbxo38, F-box only protein 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo38Q8BMI0 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fbxo38Q8BMI0 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Fbxo38Q8BMI0 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fbxo38Q8BMI0 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fbxo38Q8BMI0 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fbxo38Q8BMI0 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fbxo38Q8BMI0 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fbxo38Q8BMI0 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fbxo38Q8BMI0 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fbxo38Q8BMI0 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fbxo38Q8BMI0 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Fbxo38Q8BMI0 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Fbxo38Q8BMI0 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Fbxo38Q8BMI0 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Fbxo38Q8BMI0 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Fbxo38Q8BMI0 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Fbxo38Q8BMI0 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Fbxo38Q8BMI0 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Fbxo38Q8BMI0 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Fbxo38Q8BMI0 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fbxo38Q8BMI0 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fbxo38Q8BMI0 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fbxo38Q8BMI0 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Fbxo38Q8BMI0 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fbxo38Q8BMI0 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fbxo38Q8BMI0 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fbxo38Q8BMI0 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fbxo38Q8BMI0 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fbxo38Q8BMI0 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fbxo38Q8BMI0 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fbxo38Q8BMI0 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fbxo38Q8BMI0 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fbxo38Q8BMI0 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fbxo38Q8BMI0 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fbxo38Q8BMI0 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fbxo38Q8BMI0 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fbxo38Q8BMI0 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fbxo38Q8BMI0 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fbxo38Q8BMI0 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fbxo38Q8BMI0 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fbxo38Q8BMI0 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fbxo38Q8BMI0 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fbxo38Q8BMI0 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fbxo38Q8BMI0 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fbxo38Q8BMI0 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fbxo38Q8BMI0 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fbxo38Q8BMI0 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fbxo38Q8BMI0 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fbxo38Q8BMI0 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fbxo38Q8BMI0 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fbxo38Q8BMI0 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fbxo38Q8BMI0 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fbxo38Q8BMI0 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fbxo38Q8BMI0 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fbxo38Q8BMI0 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fbxo38Q8BMI0 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fbxo38Q8BMI0 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fbxo38Q8BMI0 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fbxo38Q8BMI0 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fbxo38Q8BMI0 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fbxo38Q8BMI0 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fbxo38Q8BMI0 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fbxo38Q8BMI0 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fbxo38Q8BMI0 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fbxo38Q8BMI0 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fbxo38Q8BMI0 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fbxo38Q8BMI0 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fbxo38Q8BMI0 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fbxo38Q8BMI0 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Fbxo38Q8BMI0 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fbxo38Q8BMI0 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fbxo38Q8BMI0 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fbxo38Q8BMI0 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fbxo38Q8BMI0 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fbxo38Q8BMI0 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fbxo38Q8BMI0 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fbxo38Q8BMI0 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fbxo38Q8BMI0 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fbxo38Q8BMI0 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fbxo38Q8BMI0 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fbxo38Q8BMI0 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fbxo38Q8BMI0 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Fbxo38Q8BMI0 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fbxo38Q8BMI0 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fbxo38Q8BMI0 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fbxo38Q8BMI0 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fbxo38Q8BMI0 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fbxo38Q8BMI0 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fbxo38Q8BMI0 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fbxo38Q8BMI0 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fbxo38Q8BMI0 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fbxo38Q8BMI0 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Fbxo38Q8BMI0 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fbxo38Q8BMI0 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fbxo38Q8BMI0 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fbxo38Q8BMI0 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fbxo38Q8BMI0 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fbxo38Q8BMI0 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fbxo38Q8BMI0 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fbxo38Q8BMI0 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms