Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMG7

Rab3gap2, Rab3 GTPase-activating protein non-catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 1,366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3gap2Q8BMG7 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Rab3gap2Q8BMG7 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rab3gap2Q8BMG7 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rab3gap2Q8BMG7 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rab3gap2Q8BMG7 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rab3gap2Q8BMG7 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rab3gap2Q8BMG7 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rab3gap2Q8BMG7 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rab3gap2Q8BMG7 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rab3gap2Q8BMG7 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rab3gap2Q8BMG7 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rab3gap2Q8BMG7 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Rab3gap2Q8BMG7 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rab3gap2Q8BMG7 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rab3gap2Q8BMG7 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rab3gap2Q8BMG7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rab3gap2Q8BMG7 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rab3gap2Q8BMG7 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rab3gap2Q8BMG7 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rab3gap2Q8BMG7 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rab3gap2Q8BMG7 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rab3gap2Q8BMG7 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rab3gap2Q8BMG7 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rab3gap2Q8BMG7 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rab3gap2Q8BMG7 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Rab3gap2Q8BMG7 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Rab3gap2Q8BMG7 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Rab3gap2Q8BMG7 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Rab3gap2Q8BMG7 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Rab3gap2Q8BMG7 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Rab3gap2Q8BMG7 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Rab3gap2Q8BMG7 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Rab3gap2Q8BMG7 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Rab3gap2Q8BMG7 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Rab3gap2Q8BMG7 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Rab3gap2Q8BMG7 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Rab3gap2Q8BMG7 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rab3gap2Q8BMG7 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rab3gap2Q8BMG7 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rab3gap2Q8BMG7 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rab3gap2Q8BMG7 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rab3gap2Q8BMG7 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rab3gap2Q8BMG7 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rab3gap2Q8BMG7 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rab3gap2Q8BMG7 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rab3gap2Q8BMG7 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rab3gap2Q8BMG7 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rab3gap2Q8BMG7 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rab3gap2Q8BMG7 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rab3gap2Q8BMG7 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rab3gap2Q8BMG7 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rab3gap2Q8BMG7 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rab3gap2Q8BMG7 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rab3gap2Q8BMG7 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rab3gap2Q8BMG7 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rab3gap2Q8BMG7 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rab3gap2Q8BMG7 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rab3gap2Q8BMG7 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Rab3gap2Q8BMG7 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rab3gap2Q8BMG7 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rab3gap2Q8BMG7 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rab3gap2Q8BMG7 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rab3gap2Q8BMG7 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rab3gap2Q8BMG7 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rab3gap2Q8BMG7 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rab3gap2Q8BMG7 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rab3gap2Q8BMG7 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rab3gap2Q8BMG7 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Rab3gap2Q8BMG7 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Rab3gap2Q8BMG7 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Rab3gap2Q8BMG7 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Rab3gap2Q8BMG7 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Rab3gap2Q8BMG7 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Rab3gap2Q8BMG7 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Rab3gap2Q8BMG7 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Rab3gap2Q8BMG7 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Rab3gap2Q8BMG7 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rab3gap2Q8BMG7 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rab3gap2Q8BMG7 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rab3gap2Q8BMG7 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rab3gap2Q8BMG7 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rab3gap2Q8BMG7 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rab3gap2Q8BMG7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rab3gap2Q8BMG7 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rab3gap2Q8BMG7 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rab3gap2Q8BMG7 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rab3gap2Q8BMG7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rab3gap2Q8BMG7 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rab3gap2Q8BMG7 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rab3gap2Q8BMG7 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rab3gap2Q8BMG7 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rab3gap2Q8BMG7 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rab3gap2Q8BMG7 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rab3gap2Q8BMG7 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rab3gap2Q8BMG7 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rab3gap2Q8BMG7 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rab3gap2Q8BMG7 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Rab3gap2Q8BMG7 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rab3gap2Q8BMG7 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rab3gap2Q8BMG7 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms