Protein–RNA interactions for Protein: Q8BLH7

Hirip3, HIRA-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hirip3Q8BLH7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Hirip3Q8BLH7 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Hirip3Q8BLH7 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Hirip3Q8BLH7 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Hirip3Q8BLH7 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Hirip3Q8BLH7 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Hirip3Q8BLH7 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Hirip3Q8BLH7 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Hirip3Q8BLH7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Hirip3Q8BLH7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Hirip3Q8BLH7 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Hirip3Q8BLH7 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Hirip3Q8BLH7 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Hirip3Q8BLH7 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Hirip3Q8BLH7 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Hirip3Q8BLH7 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Hirip3Q8BLH7 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Hirip3Q8BLH7 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Hirip3Q8BLH7 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Hirip3Q8BLH7 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Hirip3Q8BLH7 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hirip3Q8BLH7 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hirip3Q8BLH7 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hirip3Q8BLH7 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hirip3Q8BLH7 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hirip3Q8BLH7 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hirip3Q8BLH7 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hirip3Q8BLH7 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hirip3Q8BLH7 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hirip3Q8BLH7 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hirip3Q8BLH7 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hirip3Q8BLH7 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hirip3Q8BLH7 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hirip3Q8BLH7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hirip3Q8BLH7 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Hirip3Q8BLH7 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Hirip3Q8BLH7 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Hirip3Q8BLH7 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Hirip3Q8BLH7 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Hirip3Q8BLH7 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Hirip3Q8BLH7 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Hirip3Q8BLH7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Hirip3Q8BLH7 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Hirip3Q8BLH7 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Hirip3Q8BLH7 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Hirip3Q8BLH7 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Hirip3Q8BLH7 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Hirip3Q8BLH7 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Hirip3Q8BLH7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Hirip3Q8BLH7 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Hirip3Q8BLH7 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Hirip3Q8BLH7 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Hirip3Q8BLH7 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Hirip3Q8BLH7 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Hirip3Q8BLH7 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Hirip3Q8BLH7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Hirip3Q8BLH7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Hirip3Q8BLH7 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Hirip3Q8BLH7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Hirip3Q8BLH7 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Hirip3Q8BLH7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Hirip3Q8BLH7 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Hirip3Q8BLH7 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Hirip3Q8BLH7 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Hirip3Q8BLH7 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Hirip3Q8BLH7 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Hirip3Q8BLH7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hirip3Q8BLH7 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hirip3Q8BLH7 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hirip3Q8BLH7 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Hirip3Q8BLH7 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Hirip3Q8BLH7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hirip3Q8BLH7 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Hirip3Q8BLH7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Hirip3Q8BLH7 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Hirip3Q8BLH7 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Hirip3Q8BLH7 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Hirip3Q8BLH7 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Hirip3Q8BLH7 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Hirip3Q8BLH7 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Hirip3Q8BLH7 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Hirip3Q8BLH7 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Hirip3Q8BLH7 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Hirip3Q8BLH7 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Hirip3Q8BLH7 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Hirip3Q8BLH7 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Hirip3Q8BLH7 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hirip3Q8BLH7 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hirip3Q8BLH7 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hirip3Q8BLH7 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hirip3Q8BLH7 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hirip3Q8BLH7 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hirip3Q8BLH7 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hirip3Q8BLH7 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hirip3Q8BLH7 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hirip3Q8BLH7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hirip3Q8BLH7 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Hirip3Q8BLH7 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Hirip3Q8BLH7 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Hirip3Q8BLH7 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms