Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJN4

Fndc9, Fibronectin type III domain-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc9Q8BJN4 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fndc9Q8BJN4 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fndc9Q8BJN4 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fndc9Q8BJN4 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fndc9Q8BJN4 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fndc9Q8BJN4 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fndc9Q8BJN4 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fndc9Q8BJN4 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fndc9Q8BJN4 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fndc9Q8BJN4 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fndc9Q8BJN4 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fndc9Q8BJN4 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fndc9Q8BJN4 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fndc9Q8BJN4 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fndc9Q8BJN4 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fndc9Q8BJN4 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fndc9Q8BJN4 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Fndc9Q8BJN4 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fndc9Q8BJN4 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fndc9Q8BJN4 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fndc9Q8BJN4 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fndc9Q8BJN4 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fndc9Q8BJN4 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fndc9Q8BJN4 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fndc9Q8BJN4 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Fndc9Q8BJN4 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Fndc9Q8BJN4 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fndc9Q8BJN4 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fndc9Q8BJN4 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fndc9Q8BJN4 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fndc9Q8BJN4 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fndc9Q8BJN4 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fndc9Q8BJN4 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fndc9Q8BJN4 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fndc9Q8BJN4 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fndc9Q8BJN4 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fndc9Q8BJN4 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fndc9Q8BJN4 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fndc9Q8BJN4 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fndc9Q8BJN4 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fndc9Q8BJN4 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fndc9Q8BJN4 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Fndc9Q8BJN4 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Fndc9Q8BJN4 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fndc9Q8BJN4 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fndc9Q8BJN4 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fndc9Q8BJN4 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fndc9Q8BJN4 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fndc9Q8BJN4 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fndc9Q8BJN4 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fndc9Q8BJN4 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Fndc9Q8BJN4 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fndc9Q8BJN4 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fndc9Q8BJN4 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fndc9Q8BJN4 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fndc9Q8BJN4 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fndc9Q8BJN4 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fndc9Q8BJN4 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fndc9Q8BJN4 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fndc9Q8BJN4 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fndc9Q8BJN4 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fndc9Q8BJN4 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fndc9Q8BJN4 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fndc9Q8BJN4 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fndc9Q8BJN4 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fndc9Q8BJN4 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Fndc9Q8BJN4 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fndc9Q8BJN4 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fndc9Q8BJN4 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fndc9Q8BJN4 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fndc9Q8BJN4 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fndc9Q8BJN4 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fndc9Q8BJN4 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fndc9Q8BJN4 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fndc9Q8BJN4 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fndc9Q8BJN4 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fndc9Q8BJN4 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fndc9Q8BJN4 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Fndc9Q8BJN4 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fndc9Q8BJN4 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Fndc9Q8BJN4 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fndc9Q8BJN4 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Fndc9Q8BJN4 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fndc9Q8BJN4 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fndc9Q8BJN4 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Fndc9Q8BJN4 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fndc9Q8BJN4 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fndc9Q8BJN4 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fndc9Q8BJN4 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fndc9Q8BJN4 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fndc9Q8BJN4 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fndc9Q8BJN4 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fndc9Q8BJN4 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fndc9Q8BJN4 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fndc9Q8BJN4 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fndc9Q8BJN4 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fndc9Q8BJN4 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fndc9Q8BJN4 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fndc9Q8BJN4 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fndc9Q8BJN4 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms