Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE7

Trim6, Tripartite motif-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim6Q8BGE7 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim6Q8BGE7 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim6Q8BGE7 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim6Q8BGE7 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim6Q8BGE7 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim6Q8BGE7 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim6Q8BGE7 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim6Q8BGE7 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim6Q8BGE7 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim6Q8BGE7 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim6Q8BGE7 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim6Q8BGE7 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim6Q8BGE7 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim6Q8BGE7 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim6Q8BGE7 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim6Q8BGE7 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim6Q8BGE7 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim6Q8BGE7 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim6Q8BGE7 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim6Q8BGE7 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim6Q8BGE7 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim6Q8BGE7 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim6Q8BGE7 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim6Q8BGE7 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim6Q8BGE7 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim6Q8BGE7 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim6Q8BGE7 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim6Q8BGE7 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim6Q8BGE7 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim6Q8BGE7 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim6Q8BGE7 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Trim6Q8BGE7 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim6Q8BGE7 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim6Q8BGE7 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim6Q8BGE7 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim6Q8BGE7 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim6Q8BGE7 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim6Q8BGE7 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim6Q8BGE7 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim6Q8BGE7 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim6Q8BGE7 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim6Q8BGE7 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim6Q8BGE7 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim6Q8BGE7 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim6Q8BGE7 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim6Q8BGE7 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim6Q8BGE7 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim6Q8BGE7 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim6Q8BGE7 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim6Q8BGE7 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim6Q8BGE7 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim6Q8BGE7 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim6Q8BGE7 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim6Q8BGE7 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim6Q8BGE7 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim6Q8BGE7 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim6Q8BGE7 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim6Q8BGE7 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim6Q8BGE7 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim6Q8BGE7 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim6Q8BGE7 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim6Q8BGE7 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim6Q8BGE7 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim6Q8BGE7 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim6Q8BGE7 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim6Q8BGE7 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim6Q8BGE7 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim6Q8BGE7 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim6Q8BGE7 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim6Q8BGE7 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim6Q8BGE7 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim6Q8BGE7 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim6Q8BGE7 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim6Q8BGE7 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim6Q8BGE7 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim6Q8BGE7 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim6Q8BGE7 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim6Q8BGE7 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim6Q8BGE7 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim6Q8BGE7 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim6Q8BGE7 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim6Q8BGE7 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim6Q8BGE7 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim6Q8BGE7 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim6Q8BGE7 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim6Q8BGE7 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim6Q8BGE7 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim6Q8BGE7 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim6Q8BGE7 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Trim6Q8BGE7 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Trim6Q8BGE7 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Trim6Q8BGE7 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim6Q8BGE7 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim6Q8BGE7 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim6Q8BGE7 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim6Q8BGE7 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim6Q8BGE7 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim6Q8BGE7 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim6Q8BGE7 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim6Q8BGE7 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
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