Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG54

Sptlc3, Serine palmitoyltransferase 3, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptlc3Q8BG54 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sptlc3Q8BG54 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sptlc3Q8BG54 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sptlc3Q8BG54 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sptlc3Q8BG54 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sptlc3Q8BG54 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Sptlc3Q8BG54 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sptlc3Q8BG54 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sptlc3Q8BG54 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Sptlc3Q8BG54 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sptlc3Q8BG54 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sptlc3Q8BG54 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sptlc3Q8BG54 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sptlc3Q8BG54 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sptlc3Q8BG54 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sptlc3Q8BG54 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Sptlc3Q8BG54 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sptlc3Q8BG54 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sptlc3Q8BG54 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sptlc3Q8BG54 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sptlc3Q8BG54 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sptlc3Q8BG54 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sptlc3Q8BG54 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sptlc3Q8BG54 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sptlc3Q8BG54 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sptlc3Q8BG54 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sptlc3Q8BG54 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sptlc3Q8BG54 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sptlc3Q8BG54 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sptlc3Q8BG54 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sptlc3Q8BG54 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sptlc3Q8BG54 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sptlc3Q8BG54 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sptlc3Q8BG54 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sptlc3Q8BG54 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sptlc3Q8BG54 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sptlc3Q8BG54 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sptlc3Q8BG54 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sptlc3Q8BG54 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sptlc3Q8BG54 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sptlc3Q8BG54 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sptlc3Q8BG54 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sptlc3Q8BG54 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sptlc3Q8BG54 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sptlc3Q8BG54 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Sptlc3Q8BG54 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sptlc3Q8BG54 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Sptlc3Q8BG54 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sptlc3Q8BG54 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sptlc3Q8BG54 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sptlc3Q8BG54 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sptlc3Q8BG54 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sptlc3Q8BG54 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sptlc3Q8BG54 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sptlc3Q8BG54 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sptlc3Q8BG54 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sptlc3Q8BG54 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sptlc3Q8BG54 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sptlc3Q8BG54 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sptlc3Q8BG54 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sptlc3Q8BG54 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sptlc3Q8BG54 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sptlc3Q8BG54 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sptlc3Q8BG54 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sptlc3Q8BG54 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sptlc3Q8BG54 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sptlc3Q8BG54 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sptlc3Q8BG54 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sptlc3Q8BG54 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Sptlc3Q8BG54 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sptlc3Q8BG54 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sptlc3Q8BG54 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sptlc3Q8BG54 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sptlc3Q8BG54 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sptlc3Q8BG54 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sptlc3Q8BG54 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sptlc3Q8BG54 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Sptlc3Q8BG54 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sptlc3Q8BG54 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sptlc3Q8BG54 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sptlc3Q8BG54 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sptlc3Q8BG54 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sptlc3Q8BG54 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Sptlc3Q8BG54 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Sptlc3Q8BG54 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Sptlc3Q8BG54 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sptlc3Q8BG54 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sptlc3Q8BG54 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Sptlc3Q8BG54 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sptlc3Q8BG54 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sptlc3Q8BG54 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sptlc3Q8BG54 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sptlc3Q8BG54 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sptlc3Q8BG54 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sptlc3Q8BG54 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sptlc3Q8BG54 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sptlc3Q8BG54 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sptlc3Q8BG54 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sptlc3Q8BG54 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sptlc3Q8BG54 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms