Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG40

Katnb1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Katnb1Q8BG40 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Katnb1Q8BG40 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Katnb1Q8BG40 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Katnb1Q8BG40 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Katnb1Q8BG40 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Katnb1Q8BG40 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Katnb1Q8BG40 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Katnb1Q8BG40 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Katnb1Q8BG40 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Katnb1Q8BG40 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Katnb1Q8BG40 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Katnb1Q8BG40 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Katnb1Q8BG40 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Katnb1Q8BG40 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Katnb1Q8BG40 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Katnb1Q8BG40 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Katnb1Q8BG40 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Katnb1Q8BG40 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Katnb1Q8BG40 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Katnb1Q8BG40 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Katnb1Q8BG40 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Katnb1Q8BG40 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Katnb1Q8BG40 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Katnb1Q8BG40 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Katnb1Q8BG40 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Katnb1Q8BG40 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Katnb1Q8BG40 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Katnb1Q8BG40 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Katnb1Q8BG40 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Katnb1Q8BG40 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Katnb1Q8BG40 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Katnb1Q8BG40 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Katnb1Q8BG40 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Katnb1Q8BG40 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Katnb1Q8BG40 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Katnb1Q8BG40 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Katnb1Q8BG40 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Katnb1Q8BG40 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Katnb1Q8BG40 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Katnb1Q8BG40 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Katnb1Q8BG40 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Katnb1Q8BG40 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Katnb1Q8BG40 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Katnb1Q8BG40 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Katnb1Q8BG40 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Katnb1Q8BG40 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Katnb1Q8BG40 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Katnb1Q8BG40 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Katnb1Q8BG40 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Katnb1Q8BG40 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Katnb1Q8BG40 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Katnb1Q8BG40 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Katnb1Q8BG40 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Katnb1Q8BG40 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Katnb1Q8BG40 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Katnb1Q8BG40 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Katnb1Q8BG40 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Katnb1Q8BG40 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Katnb1Q8BG40 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Katnb1Q8BG40 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Katnb1Q8BG40 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Katnb1Q8BG40 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Katnb1Q8BG40 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Katnb1Q8BG40 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Katnb1Q8BG40 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Katnb1Q8BG40 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Katnb1Q8BG40 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Katnb1Q8BG40 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Katnb1Q8BG40 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Katnb1Q8BG40 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Katnb1Q8BG40 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Katnb1Q8BG40 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Katnb1Q8BG40 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Katnb1Q8BG40 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Katnb1Q8BG40 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Katnb1Q8BG40 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Katnb1Q8BG40 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Katnb1Q8BG40 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Katnb1Q8BG40 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Katnb1Q8BG40 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Katnb1Q8BG40 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Katnb1Q8BG40 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Katnb1Q8BG40 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Katnb1Q8BG40 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Katnb1Q8BG40 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Katnb1Q8BG40 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Katnb1Q8BG40 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Katnb1Q8BG40 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Katnb1Q8BG40 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Katnb1Q8BG40 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Katnb1Q8BG40 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Katnb1Q8BG40 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Katnb1Q8BG40 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Katnb1Q8BG40 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Katnb1Q8BG40 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Katnb1Q8BG40 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Katnb1Q8BG40 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Katnb1Q8BG40 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Katnb1Q8BG40 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Katnb1Q8BG40 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms