Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG18

Necab1, N-terminal EF-hand calcium-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Necab1Q8BG18 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Necab1Q8BG18 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Necab1Q8BG18 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Necab1Q8BG18 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Necab1Q8BG18 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Necab1Q8BG18 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Necab1Q8BG18 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Necab1Q8BG18 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Necab1Q8BG18 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Necab1Q8BG18 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Necab1Q8BG18 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Necab1Q8BG18 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Necab1Q8BG18 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Necab1Q8BG18 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Necab1Q8BG18 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Necab1Q8BG18 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Necab1Q8BG18 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Necab1Q8BG18 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Necab1Q8BG18 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Necab1Q8BG18 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Necab1Q8BG18 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Necab1Q8BG18 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Necab1Q8BG18 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Necab1Q8BG18 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Necab1Q8BG18 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Necab1Q8BG18 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Necab1Q8BG18 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Necab1Q8BG18 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Necab1Q8BG18 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Necab1Q8BG18 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Necab1Q8BG18 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Necab1Q8BG18 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Necab1Q8BG18 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Necab1Q8BG18 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Necab1Q8BG18 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Necab1Q8BG18 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Necab1Q8BG18 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Necab1Q8BG18 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Necab1Q8BG18 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Necab1Q8BG18 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Necab1Q8BG18 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Necab1Q8BG18 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Necab1Q8BG18 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Necab1Q8BG18 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Necab1Q8BG18 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Necab1Q8BG18 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Necab1Q8BG18 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Necab1Q8BG18 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Necab1Q8BG18 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Necab1Q8BG18 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Necab1Q8BG18 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Necab1Q8BG18 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Necab1Q8BG18 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Necab1Q8BG18 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Necab1Q8BG18 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Necab1Q8BG18 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Necab1Q8BG18 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Necab1Q8BG18 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Necab1Q8BG18 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Necab1Q8BG18 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Necab1Q8BG18 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Necab1Q8BG18 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Necab1Q8BG18 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Necab1Q8BG18 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Necab1Q8BG18 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Necab1Q8BG18 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Necab1Q8BG18 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Necab1Q8BG18 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Necab1Q8BG18 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Necab1Q8BG18 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Necab1Q8BG18 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Necab1Q8BG18 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Necab1Q8BG18 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Necab1Q8BG18 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Necab1Q8BG18 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Necab1Q8BG18 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Necab1Q8BG18 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Necab1Q8BG18 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Necab1Q8BG18 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Necab1Q8BG18 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Necab1Q8BG18 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Necab1Q8BG18 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Necab1Q8BG18 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Necab1Q8BG18 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Necab1Q8BG18 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Necab1Q8BG18 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Necab1Q8BG18 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Necab1Q8BG18 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Necab1Q8BG18 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Necab1Q8BG18 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Necab1Q8BG18 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Necab1Q8BG18 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Necab1Q8BG18 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Necab1Q8BG18 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Necab1Q8BG18 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Necab1Q8BG18 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Necab1Q8BG18 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Necab1Q8BG18 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Necab1Q8BG18 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Necab1Q8BG18 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms