Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG15

Ctdspl2, CTD small phosphatase-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdspl2Q8BG15 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Ctdspl2Q8BG15 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ctdspl2Q8BG15 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ctdspl2Q8BG15 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ctdspl2Q8BG15 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ctdspl2Q8BG15 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ctdspl2Q8BG15 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ctdspl2Q8BG15 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ctdspl2Q8BG15 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ctdspl2Q8BG15 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ctdspl2Q8BG15 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ctdspl2Q8BG15 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Ctdspl2Q8BG15 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ctdspl2Q8BG15 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ctdspl2Q8BG15 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ctdspl2Q8BG15 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ctdspl2Q8BG15 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ctdspl2Q8BG15 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ctdspl2Q8BG15 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ctdspl2Q8BG15 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ctdspl2Q8BG15 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ctdspl2Q8BG15 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ctdspl2Q8BG15 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ctdspl2Q8BG15 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ctdspl2Q8BG15 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ctdspl2Q8BG15 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ctdspl2Q8BG15 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ctdspl2Q8BG15 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ctdspl2Q8BG15 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ctdspl2Q8BG15 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ctdspl2Q8BG15 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ctdspl2Q8BG15 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Ctdspl2Q8BG15 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ctdspl2Q8BG15 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ctdspl2Q8BG15 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ctdspl2Q8BG15 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ctdspl2Q8BG15 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ctdspl2Q8BG15 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ctdspl2Q8BG15 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ctdspl2Q8BG15 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ctdspl2Q8BG15 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ctdspl2Q8BG15 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ctdspl2Q8BG15 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ctdspl2Q8BG15 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ctdspl2Q8BG15 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ctdspl2Q8BG15 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ctdspl2Q8BG15 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ctdspl2Q8BG15 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ctdspl2Q8BG15 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ctdspl2Q8BG15 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ctdspl2Q8BG15 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ctdspl2Q8BG15 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Ctdspl2Q8BG15 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ctdspl2Q8BG15 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ctdspl2Q8BG15 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ctdspl2Q8BG15 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ctdspl2Q8BG15 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ctdspl2Q8BG15 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Ctdspl2Q8BG15 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ctdspl2Q8BG15 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ctdspl2Q8BG15 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ctdspl2Q8BG15 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Ctdspl2Q8BG15 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ctdspl2Q8BG15 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ctdspl2Q8BG15 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ctdspl2Q8BG15 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ctdspl2Q8BG15 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ctdspl2Q8BG15 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ctdspl2Q8BG15 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ctdspl2Q8BG15 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ctdspl2Q8BG15 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ctdspl2Q8BG15 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ctdspl2Q8BG15 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ctdspl2Q8BG15 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ctdspl2Q8BG15 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ctdspl2Q8BG15 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ctdspl2Q8BG15 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ctdspl2Q8BG15 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ctdspl2Q8BG15 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ctdspl2Q8BG15 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ctdspl2Q8BG15 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ctdspl2Q8BG15 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ctdspl2Q8BG15 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ctdspl2Q8BG15 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ctdspl2Q8BG15 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ctdspl2Q8BG15 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ctdspl2Q8BG15 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ctdspl2Q8BG15 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ctdspl2Q8BG15 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ctdspl2Q8BG15 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ctdspl2Q8BG15 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Ctdspl2Q8BG15 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ctdspl2Q8BG15 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ctdspl2Q8BG15 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ctdspl2Q8BG15 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ctdspl2Q8BG15 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ctdspl2Q8BG15 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ctdspl2Q8BG15 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ctdspl2Q8BG15 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ctdspl2Q8BG15 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms