Protein–RNA interactions for Protein: Q810N9

Ccdc172, Coiled-coil domain-containing protein 172, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc172Q810N9 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc172Q810N9 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc172Q810N9 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc172Q810N9 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc172Q810N9 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc172Q810N9 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc172Q810N9 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc172Q810N9 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc172Q810N9 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc172Q810N9 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc172Q810N9 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc172Q810N9 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc172Q810N9 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc172Q810N9 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc172Q810N9 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc172Q810N9 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc172Q810N9 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc172Q810N9 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc172Q810N9 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc172Q810N9 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc172Q810N9 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc172Q810N9 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc172Q810N9 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc172Q810N9 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc172Q810N9 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc172Q810N9 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc172Q810N9 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc172Q810N9 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc172Q810N9 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc172Q810N9 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc172Q810N9 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc172Q810N9 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc172Q810N9 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc172Q810N9 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc172Q810N9 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc172Q810N9 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc172Q810N9 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc172Q810N9 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc172Q810N9 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc172Q810N9 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc172Q810N9 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc172Q810N9 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc172Q810N9 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc172Q810N9 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc172Q810N9 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc172Q810N9 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc172Q810N9 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc172Q810N9 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc172Q810N9 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc172Q810N9 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc172Q810N9 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc172Q810N9 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc172Q810N9 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccdc172Q810N9 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc172Q810N9 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc172Q810N9 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc172Q810N9 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc172Q810N9 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc172Q810N9 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc172Q810N9 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc172Q810N9 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc172Q810N9 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc172Q810N9 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc172Q810N9 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc172Q810N9 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc172Q810N9 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc172Q810N9 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc172Q810N9 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc172Q810N9 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc172Q810N9 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc172Q810N9 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc172Q810N9 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc172Q810N9 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc172Q810N9 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc172Q810N9 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc172Q810N9 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc172Q810N9 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc172Q810N9 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc172Q810N9 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc172Q810N9 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc172Q810N9 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc172Q810N9 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc172Q810N9 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc172Q810N9 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc172Q810N9 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc172Q810N9 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc172Q810N9 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc172Q810N9 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc172Q810N9 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc172Q810N9 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc172Q810N9 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc172Q810N9 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc172Q810N9 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc172Q810N9 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc172Q810N9 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc172Q810N9 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc172Q810N9 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc172Q810N9 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc172Q810N9 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc172Q810N9 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms