Protein–RNA interactions for Protein: Q80Y84

Kdm5b, Lysine-specific demethylase 5B, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5bQ80Y84 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.66
Kdm5bQ80Y84 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC31.7■■■□□ 2.66
Kdm5bQ80Y84 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Kdm5bQ80Y84 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
Kdm5bQ80Y84 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
Kdm5bQ80Y84 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Kdm5bQ80Y84 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Kdm5bQ80Y84 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC31.69■■■□□ 2.66
Kdm5bQ80Y84 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Kdm5bQ80Y84 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC31.68■■■□□ 2.66
Kdm5bQ80Y84 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Kdm5bQ80Y84 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
Kdm5bQ80Y84 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
Kdm5bQ80Y84 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
Kdm5bQ80Y84 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Kdm5bQ80Y84 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Kdm5bQ80Y84 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Kdm5bQ80Y84 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Kdm5bQ80Y84 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Kdm5bQ80Y84 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Kdm5bQ80Y84 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Kdm5bQ80Y84 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Kdm5bQ80Y84 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
Kdm5bQ80Y84 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Kdm5bQ80Y84 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
Kdm5bQ80Y84 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
Kdm5bQ80Y84 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Kdm5bQ80Y84 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Kdm5bQ80Y84 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Kdm5bQ80Y84 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
Kdm5bQ80Y84 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Kdm5bQ80Y84 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC31.65■■■□□ 2.66
Kdm5bQ80Y84 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Kdm5bQ80Y84 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Kdm5bQ80Y84 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Kdm5bQ80Y84 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Kdm5bQ80Y84 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
Kdm5bQ80Y84 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC31.63■■■□□ 2.65
Kdm5bQ80Y84 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Kdm5bQ80Y84 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Kdm5bQ80Y84 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Kdm5bQ80Y84 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC31.62■■■□□ 2.65
Kdm5bQ80Y84 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Kdm5bQ80Y84 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC31.62■■■□□ 2.65
Kdm5bQ80Y84 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Kdm5bQ80Y84 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Kdm5bQ80Y84 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Kdm5bQ80Y84 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
Kdm5bQ80Y84 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
Kdm5bQ80Y84 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
Kdm5bQ80Y84 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Kdm5bQ80Y84 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Kdm5bQ80Y84 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Kdm5bQ80Y84 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Kdm5bQ80Y84 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Kdm5bQ80Y84 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
Kdm5bQ80Y84 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Kdm5bQ80Y84 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Kdm5bQ80Y84 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Kdm5bQ80Y84 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Kdm5bQ80Y84 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Kdm5bQ80Y84 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Kdm5bQ80Y84 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Kdm5bQ80Y84 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Kdm5bQ80Y84 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Kdm5bQ80Y84 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Kdm5bQ80Y84 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
Kdm5bQ80Y84 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC31.58■■■□□ 2.65
Kdm5bQ80Y84 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Kdm5bQ80Y84 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Kdm5bQ80Y84 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC31.58■■■□□ 2.65
Kdm5bQ80Y84 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Kdm5bQ80Y84 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
Kdm5bQ80Y84 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Kdm5bQ80Y84 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.65
Kdm5bQ80Y84 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Kdm5bQ80Y84 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
Kdm5bQ80Y84 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Kdm5bQ80Y84 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC31.57■■■□□ 2.64
Kdm5bQ80Y84 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Kdm5bQ80Y84 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Kdm5bQ80Y84 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Kdm5bQ80Y84 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Kdm5bQ80Y84 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
Kdm5bQ80Y84 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
Kdm5bQ80Y84 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Kdm5bQ80Y84 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Kdm5bQ80Y84 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Kdm5bQ80Y84 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC31.54■■■□□ 2.64
Kdm5bQ80Y84 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Kdm5bQ80Y84 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
Kdm5bQ80Y84 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Kdm5bQ80Y84 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
Kdm5bQ80Y84 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Kdm5bQ80Y84 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
Kdm5bQ80Y84 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Kdm5bQ80Y84 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Kdm5bQ80Y84 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Kdm5bQ80Y84 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC31.52■■■□□ 2.64
Kdm5bQ80Y84 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms