Protein–RNA interactions for Protein: Q80WQ9

Zbed4, Zinc finger BED domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed4Q80WQ9 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zbed4Q80WQ9 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zbed4Q80WQ9 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zbed4Q80WQ9 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zbed4Q80WQ9 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zbed4Q80WQ9 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zbed4Q80WQ9 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zbed4Q80WQ9 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zbed4Q80WQ9 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zbed4Q80WQ9 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zbed4Q80WQ9 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zbed4Q80WQ9 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zbed4Q80WQ9 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zbed4Q80WQ9 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zbed4Q80WQ9 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Zbed4Q80WQ9 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zbed4Q80WQ9 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zbed4Q80WQ9 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zbed4Q80WQ9 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zbed4Q80WQ9 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zbed4Q80WQ9 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zbed4Q80WQ9 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Zbed4Q80WQ9 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Zbed4Q80WQ9 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zbed4Q80WQ9 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zbed4Q80WQ9 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Zbed4Q80WQ9 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Zbed4Q80WQ9 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Zbed4Q80WQ9 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Zbed4Q80WQ9 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Zbed4Q80WQ9 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Zbed4Q80WQ9 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Zbed4Q80WQ9 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Zbed4Q80WQ9 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Zbed4Q80WQ9 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zbed4Q80WQ9 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zbed4Q80WQ9 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zbed4Q80WQ9 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zbed4Q80WQ9 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zbed4Q80WQ9 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zbed4Q80WQ9 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zbed4Q80WQ9 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zbed4Q80WQ9 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zbed4Q80WQ9 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zbed4Q80WQ9 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zbed4Q80WQ9 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zbed4Q80WQ9 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zbed4Q80WQ9 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zbed4Q80WQ9 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zbed4Q80WQ9 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zbed4Q80WQ9 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zbed4Q80WQ9 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zbed4Q80WQ9 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zbed4Q80WQ9 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zbed4Q80WQ9 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zbed4Q80WQ9 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zbed4Q80WQ9 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zbed4Q80WQ9 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zbed4Q80WQ9 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zbed4Q80WQ9 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zbed4Q80WQ9 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zbed4Q80WQ9 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zbed4Q80WQ9 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zbed4Q80WQ9 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zbed4Q80WQ9 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zbed4Q80WQ9 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zbed4Q80WQ9 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zbed4Q80WQ9 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zbed4Q80WQ9 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Zbed4Q80WQ9 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Zbed4Q80WQ9 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Zbed4Q80WQ9 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Zbed4Q80WQ9 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Zbed4Q80WQ9 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Zbed4Q80WQ9 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Zbed4Q80WQ9 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Zbed4Q80WQ9 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Zbed4Q80WQ9 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Zbed4Q80WQ9 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Zbed4Q80WQ9 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Zbed4Q80WQ9 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Zbed4Q80WQ9 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zbed4Q80WQ9 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zbed4Q80WQ9 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Zbed4Q80WQ9 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zbed4Q80WQ9 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zbed4Q80WQ9 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zbed4Q80WQ9 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zbed4Q80WQ9 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zbed4Q80WQ9 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zbed4Q80WQ9 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zbed4Q80WQ9 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zbed4Q80WQ9 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zbed4Q80WQ9 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zbed4Q80WQ9 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zbed4Q80WQ9 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zbed4Q80WQ9 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zbed4Q80WQ9 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zbed4Q80WQ9 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zbed4Q80WQ9 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms