Protein–RNA interactions for Protein: Q80W22

Thnsl2, Threonine synthase-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thnsl2Q80W22 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Thnsl2Q80W22 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Thnsl2Q80W22 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Thnsl2Q80W22 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Thnsl2Q80W22 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Thnsl2Q80W22 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Thnsl2Q80W22 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Thnsl2Q80W22 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Thnsl2Q80W22 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Thnsl2Q80W22 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Thnsl2Q80W22 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Thnsl2Q80W22 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Thnsl2Q80W22 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Thnsl2Q80W22 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Thnsl2Q80W22 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Thnsl2Q80W22 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Thnsl2Q80W22 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Thnsl2Q80W22 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
Thnsl2Q80W22 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Thnsl2Q80W22 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Thnsl2Q80W22 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Thnsl2Q80W22 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Thnsl2Q80W22 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Thnsl2Q80W22 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Thnsl2Q80W22 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Thnsl2Q80W22 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Thnsl2Q80W22 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Thnsl2Q80W22 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Thnsl2Q80W22 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Thnsl2Q80W22 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Thnsl2Q80W22 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Thnsl2Q80W22 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Thnsl2Q80W22 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Thnsl2Q80W22 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Thnsl2Q80W22 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Thnsl2Q80W22 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Thnsl2Q80W22 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Thnsl2Q80W22 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Thnsl2Q80W22 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Thnsl2Q80W22 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Thnsl2Q80W22 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Thnsl2Q80W22 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Thnsl2Q80W22 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Thnsl2Q80W22 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Thnsl2Q80W22 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Thnsl2Q80W22 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Thnsl2Q80W22 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Thnsl2Q80W22 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Thnsl2Q80W22 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Thnsl2Q80W22 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Thnsl2Q80W22 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Thnsl2Q80W22 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Thnsl2Q80W22 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Thnsl2Q80W22 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Thnsl2Q80W22 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Thnsl2Q80W22 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Thnsl2Q80W22 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Thnsl2Q80W22 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Thnsl2Q80W22 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Thnsl2Q80W22 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Thnsl2Q80W22 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Thnsl2Q80W22 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Thnsl2Q80W22 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Thnsl2Q80W22 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Thnsl2Q80W22 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Thnsl2Q80W22 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Thnsl2Q80W22 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Thnsl2Q80W22 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Thnsl2Q80W22 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Thnsl2Q80W22 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Thnsl2Q80W22 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Thnsl2Q80W22 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Thnsl2Q80W22 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Thnsl2Q80W22 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Thnsl2Q80W22 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Thnsl2Q80W22 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Thnsl2Q80W22 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Thnsl2Q80W22 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Thnsl2Q80W22 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Thnsl2Q80W22 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Thnsl2Q80W22 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Thnsl2Q80W22 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Thnsl2Q80W22 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Thnsl2Q80W22 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Thnsl2Q80W22 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Thnsl2Q80W22 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Thnsl2Q80W22 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Thnsl2Q80W22 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Thnsl2Q80W22 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Thnsl2Q80W22 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Thnsl2Q80W22 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Thnsl2Q80W22 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Thnsl2Q80W22 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Thnsl2Q80W22 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Thnsl2Q80W22 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Thnsl2Q80W22 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Thnsl2Q80W22 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Thnsl2Q80W22 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Thnsl2Q80W22 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Thnsl2Q80W22 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms