Protein–RNA interactions for Protein: Q80UW8

Polr2e, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2eQ80UW8 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Polr2eQ80UW8 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Polr2eQ80UW8 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Polr2eQ80UW8 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Polr2eQ80UW8 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Polr2eQ80UW8 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Polr2eQ80UW8 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Polr2eQ80UW8 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Polr2eQ80UW8 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Polr2eQ80UW8 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Polr2eQ80UW8 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Polr2eQ80UW8 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Polr2eQ80UW8 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Polr2eQ80UW8 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Polr2eQ80UW8 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Polr2eQ80UW8 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Polr2eQ80UW8 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Polr2eQ80UW8 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Polr2eQ80UW8 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Polr2eQ80UW8 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Polr2eQ80UW8 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Polr2eQ80UW8 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Polr2eQ80UW8 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Polr2eQ80UW8 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Polr2eQ80UW8 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Polr2eQ80UW8 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Polr2eQ80UW8 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Polr2eQ80UW8 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Polr2eQ80UW8 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Polr2eQ80UW8 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Polr2eQ80UW8 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Polr2eQ80UW8 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Polr2eQ80UW8 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Polr2eQ80UW8 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Polr2eQ80UW8 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Polr2eQ80UW8 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Polr2eQ80UW8 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Polr2eQ80UW8 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Polr2eQ80UW8 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Polr2eQ80UW8 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Polr2eQ80UW8 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Polr2eQ80UW8 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Polr2eQ80UW8 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Polr2eQ80UW8 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Polr2eQ80UW8 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Polr2eQ80UW8 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Polr2eQ80UW8 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Polr2eQ80UW8 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Polr2eQ80UW8 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Polr2eQ80UW8 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Polr2eQ80UW8 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Polr2eQ80UW8 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Polr2eQ80UW8 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Polr2eQ80UW8 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Polr2eQ80UW8 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Polr2eQ80UW8 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Polr2eQ80UW8 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Polr2eQ80UW8 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Polr2eQ80UW8 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Polr2eQ80UW8 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Polr2eQ80UW8 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Polr2eQ80UW8 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Polr2eQ80UW8 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Polr2eQ80UW8 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Polr2eQ80UW8 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Polr2eQ80UW8 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Polr2eQ80UW8 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Polr2eQ80UW8 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Polr2eQ80UW8 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Polr2eQ80UW8 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Polr2eQ80UW8 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Polr2eQ80UW8 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Polr2eQ80UW8 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Polr2eQ80UW8 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Polr2eQ80UW8 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Polr2eQ80UW8 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Polr2eQ80UW8 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Polr2eQ80UW8 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Polr2eQ80UW8 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Polr2eQ80UW8 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Polr2eQ80UW8 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Polr2eQ80UW8 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Polr2eQ80UW8 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Polr2eQ80UW8 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Polr2eQ80UW8 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Polr2eQ80UW8 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Polr2eQ80UW8 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Polr2eQ80UW8 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Polr2eQ80UW8 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Polr2eQ80UW8 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Polr2eQ80UW8 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Polr2eQ80UW8 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Polr2eQ80UW8 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Polr2eQ80UW8 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Polr2eQ80UW8 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Polr2eQ80UW8 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Polr2eQ80UW8 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Polr2eQ80UW8 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Polr2eQ80UW8 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Polr2eQ80UW8 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
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