Protein–RNA interactions for Protein: Q80UK0

Sestd1, SEC14 domain and spectrin repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 696 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sestd1Q80UK0 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sestd1Q80UK0 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sestd1Q80UK0 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Sestd1Q80UK0 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Sestd1Q80UK0 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sestd1Q80UK0 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sestd1Q80UK0 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Sestd1Q80UK0 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sestd1Q80UK0 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sestd1Q80UK0 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sestd1Q80UK0 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sestd1Q80UK0 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sestd1Q80UK0 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sestd1Q80UK0 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sestd1Q80UK0 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sestd1Q80UK0 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sestd1Q80UK0 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Sestd1Q80UK0 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Sestd1Q80UK0 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sestd1Q80UK0 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sestd1Q80UK0 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sestd1Q80UK0 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sestd1Q80UK0 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sestd1Q80UK0 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sestd1Q80UK0 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sestd1Q80UK0 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sestd1Q80UK0 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sestd1Q80UK0 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sestd1Q80UK0 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sestd1Q80UK0 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sestd1Q80UK0 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sestd1Q80UK0 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sestd1Q80UK0 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sestd1Q80UK0 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sestd1Q80UK0 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sestd1Q80UK0 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sestd1Q80UK0 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sestd1Q80UK0 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sestd1Q80UK0 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sestd1Q80UK0 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sestd1Q80UK0 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sestd1Q80UK0 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sestd1Q80UK0 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sestd1Q80UK0 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sestd1Q80UK0 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sestd1Q80UK0 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sestd1Q80UK0 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sestd1Q80UK0 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sestd1Q80UK0 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sestd1Q80UK0 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sestd1Q80UK0 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sestd1Q80UK0 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sestd1Q80UK0 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sestd1Q80UK0 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sestd1Q80UK0 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sestd1Q80UK0 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Sestd1Q80UK0 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Sestd1Q80UK0 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sestd1Q80UK0 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sestd1Q80UK0 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sestd1Q80UK0 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sestd1Q80UK0 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Sestd1Q80UK0 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sestd1Q80UK0 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sestd1Q80UK0 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sestd1Q80UK0 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sestd1Q80UK0 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sestd1Q80UK0 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sestd1Q80UK0 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sestd1Q80UK0 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sestd1Q80UK0 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sestd1Q80UK0 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sestd1Q80UK0 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sestd1Q80UK0 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sestd1Q80UK0 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sestd1Q80UK0 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sestd1Q80UK0 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sestd1Q80UK0 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sestd1Q80UK0 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sestd1Q80UK0 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sestd1Q80UK0 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sestd1Q80UK0 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sestd1Q80UK0 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sestd1Q80UK0 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sestd1Q80UK0 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sestd1Q80UK0 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sestd1Q80UK0 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sestd1Q80UK0 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sestd1Q80UK0 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sestd1Q80UK0 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Sestd1Q80UK0 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sestd1Q80UK0 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sestd1Q80UK0 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sestd1Q80UK0 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sestd1Q80UK0 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sestd1Q80UK0 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sestd1Q80UK0 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sestd1Q80UK0 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Sestd1Q80UK0 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sestd1Q80UK0 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms