Protein–RNA interactions for Protein: Q80UG2

Plxna4, Plexin-A4, mousemouse

Predictions only

Length 1,893 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plxna4Q80UG2 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Plxna4Q80UG2 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Plxna4Q80UG2 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Plxna4Q80UG2 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Plxna4Q80UG2 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Plxna4Q80UG2 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Plxna4Q80UG2 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Plxna4Q80UG2 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Plxna4Q80UG2 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Plxna4Q80UG2 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Plxna4Q80UG2 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Plxna4Q80UG2 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Plxna4Q80UG2 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Plxna4Q80UG2 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Plxna4Q80UG2 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Plxna4Q80UG2 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Plxna4Q80UG2 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Plxna4Q80UG2 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Plxna4Q80UG2 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Plxna4Q80UG2 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Plxna4Q80UG2 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Plxna4Q80UG2 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Plxna4Q80UG2 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Plxna4Q80UG2 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Plxna4Q80UG2 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Plxna4Q80UG2 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Plxna4Q80UG2 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Plxna4Q80UG2 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Plxna4Q80UG2 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Plxna4Q80UG2 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Plxna4Q80UG2 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Plxna4Q80UG2 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Plxna4Q80UG2 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Plxna4Q80UG2 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Plxna4Q80UG2 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Plxna4Q80UG2 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Plxna4Q80UG2 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Plxna4Q80UG2 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Plxna4Q80UG2 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Plxna4Q80UG2 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Plxna4Q80UG2 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Plxna4Q80UG2 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Plxna4Q80UG2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Plxna4Q80UG2 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Plxna4Q80UG2 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Plxna4Q80UG2 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Plxna4Q80UG2 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Plxna4Q80UG2 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Plxna4Q80UG2 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Plxna4Q80UG2 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Plxna4Q80UG2 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Plxna4Q80UG2 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Plxna4Q80UG2 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Plxna4Q80UG2 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Plxna4Q80UG2 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Plxna4Q80UG2 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Plxna4Q80UG2 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Plxna4Q80UG2 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Plxna4Q80UG2 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Plxna4Q80UG2 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Plxna4Q80UG2 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Plxna4Q80UG2 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Plxna4Q80UG2 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Plxna4Q80UG2 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Plxna4Q80UG2 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Plxna4Q80UG2 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Plxna4Q80UG2 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Plxna4Q80UG2 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Plxna4Q80UG2 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Plxna4Q80UG2 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Plxna4Q80UG2 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Plxna4Q80UG2 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Plxna4Q80UG2 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Plxna4Q80UG2 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Plxna4Q80UG2 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Plxna4Q80UG2 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Plxna4Q80UG2 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Plxna4Q80UG2 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Plxna4Q80UG2 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Plxna4Q80UG2 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Plxna4Q80UG2 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Plxna4Q80UG2 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Plxna4Q80UG2 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Plxna4Q80UG2 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Plxna4Q80UG2 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Plxna4Q80UG2 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Plxna4Q80UG2 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Plxna4Q80UG2 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Plxna4Q80UG2 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Plxna4Q80UG2 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Plxna4Q80UG2 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Plxna4Q80UG2 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Plxna4Q80UG2 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Plxna4Q80UG2 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Plxna4Q80UG2 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Plxna4Q80UG2 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Plxna4Q80UG2 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Plxna4Q80UG2 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Plxna4Q80UG2 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Plxna4Q80UG2 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms