Protein–RNA interactions for Protein: Q80TJ7

Phf8, Histone lysine demethylase PHF8, mousemouse

Predictions only

Length 1,023 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf8Q80TJ7 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Phf8Q80TJ7 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Phf8Q80TJ7 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Phf8Q80TJ7 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Phf8Q80TJ7 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Phf8Q80TJ7 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Phf8Q80TJ7 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Phf8Q80TJ7 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Phf8Q80TJ7 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Phf8Q80TJ7 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Phf8Q80TJ7 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Phf8Q80TJ7 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Phf8Q80TJ7 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Phf8Q80TJ7 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Phf8Q80TJ7 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Phf8Q80TJ7 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Phf8Q80TJ7 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Phf8Q80TJ7 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Phf8Q80TJ7 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Phf8Q80TJ7 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Phf8Q80TJ7 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Phf8Q80TJ7 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Phf8Q80TJ7 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Phf8Q80TJ7 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Phf8Q80TJ7 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Phf8Q80TJ7 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Phf8Q80TJ7 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Phf8Q80TJ7 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Phf8Q80TJ7 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Phf8Q80TJ7 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Phf8Q80TJ7 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Phf8Q80TJ7 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Phf8Q80TJ7 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Phf8Q80TJ7 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Phf8Q80TJ7 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Phf8Q80TJ7 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Phf8Q80TJ7 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Phf8Q80TJ7 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Phf8Q80TJ7 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Phf8Q80TJ7 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Phf8Q80TJ7 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Phf8Q80TJ7 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Phf8Q80TJ7 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Phf8Q80TJ7 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Phf8Q80TJ7 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Phf8Q80TJ7 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Phf8Q80TJ7 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Phf8Q80TJ7 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Phf8Q80TJ7 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Phf8Q80TJ7 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Phf8Q80TJ7 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Phf8Q80TJ7 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Phf8Q80TJ7 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Phf8Q80TJ7 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Phf8Q80TJ7 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Phf8Q80TJ7 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Phf8Q80TJ7 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Phf8Q80TJ7 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Phf8Q80TJ7 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Phf8Q80TJ7 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Phf8Q80TJ7 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Phf8Q80TJ7 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Phf8Q80TJ7 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Phf8Q80TJ7 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Phf8Q80TJ7 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Phf8Q80TJ7 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Phf8Q80TJ7 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Phf8Q80TJ7 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Phf8Q80TJ7 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Phf8Q80TJ7 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Phf8Q80TJ7 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Phf8Q80TJ7 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Phf8Q80TJ7 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Phf8Q80TJ7 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Phf8Q80TJ7 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Phf8Q80TJ7 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Phf8Q80TJ7 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Phf8Q80TJ7 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Phf8Q80TJ7 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Phf8Q80TJ7 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Phf8Q80TJ7 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Phf8Q80TJ7 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Phf8Q80TJ7 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Phf8Q80TJ7 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Phf8Q80TJ7 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Phf8Q80TJ7 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Phf8Q80TJ7 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Phf8Q80TJ7 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Phf8Q80TJ7 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Phf8Q80TJ7 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Phf8Q80TJ7 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Phf8Q80TJ7 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Phf8Q80TJ7 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Phf8Q80TJ7 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Phf8Q80TJ7 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Phf8Q80TJ7 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Phf8Q80TJ7 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Phf8Q80TJ7 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Phf8Q80TJ7 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Phf8Q80TJ7 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms