Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT18

Atf7ip, Activating transcription factor 7-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf7ipQ7TT18 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Atf7ipQ7TT18 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Atf7ipQ7TT18 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Atf7ipQ7TT18 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Atf7ipQ7TT18 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Atf7ipQ7TT18 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Atf7ipQ7TT18 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Atf7ipQ7TT18 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Atf7ipQ7TT18 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Atf7ipQ7TT18 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Atf7ipQ7TT18 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Atf7ipQ7TT18 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Atf7ipQ7TT18 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Atf7ipQ7TT18 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Atf7ipQ7TT18 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Atf7ipQ7TT18 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Atf7ipQ7TT18 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Atf7ipQ7TT18 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Atf7ipQ7TT18 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Atf7ipQ7TT18 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Atf7ipQ7TT18 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Atf7ipQ7TT18 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Atf7ipQ7TT18 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Atf7ipQ7TT18 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Atf7ipQ7TT18 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Atf7ipQ7TT18 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Atf7ipQ7TT18 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Atf7ipQ7TT18 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Atf7ipQ7TT18 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Atf7ipQ7TT18 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Atf7ipQ7TT18 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Atf7ipQ7TT18 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Atf7ipQ7TT18 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Atf7ipQ7TT18 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Atf7ipQ7TT18 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Atf7ipQ7TT18 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Atf7ipQ7TT18 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Atf7ipQ7TT18 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Atf7ipQ7TT18 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Atf7ipQ7TT18 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Atf7ipQ7TT18 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Atf7ipQ7TT18 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Atf7ipQ7TT18 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Atf7ipQ7TT18 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Atf7ipQ7TT18 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Atf7ipQ7TT18 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Atf7ipQ7TT18 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Atf7ipQ7TT18 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Atf7ipQ7TT18 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Atf7ipQ7TT18 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Atf7ipQ7TT18 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Atf7ipQ7TT18 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Atf7ipQ7TT18 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Atf7ipQ7TT18 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Atf7ipQ7TT18 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Atf7ipQ7TT18 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Atf7ipQ7TT18 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Atf7ipQ7TT18 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Atf7ipQ7TT18 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Atf7ipQ7TT18 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Atf7ipQ7TT18 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Atf7ipQ7TT18 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Atf7ipQ7TT18 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Atf7ipQ7TT18 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Atf7ipQ7TT18 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Atf7ipQ7TT18 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Atf7ipQ7TT18 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Atf7ipQ7TT18 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Atf7ipQ7TT18 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Atf7ipQ7TT18 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Atf7ipQ7TT18 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Atf7ipQ7TT18 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Atf7ipQ7TT18 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Atf7ipQ7TT18 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Atf7ipQ7TT18 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Atf7ipQ7TT18 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Atf7ipQ7TT18 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Atf7ipQ7TT18 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Atf7ipQ7TT18 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Atf7ipQ7TT18 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Atf7ipQ7TT18 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Atf7ipQ7TT18 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Atf7ipQ7TT18 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Atf7ipQ7TT18 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Atf7ipQ7TT18 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Atf7ipQ7TT18 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Atf7ipQ7TT18 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Atf7ipQ7TT18 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Atf7ipQ7TT18 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Atf7ipQ7TT18 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Atf7ipQ7TT18 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Atf7ipQ7TT18 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Atf7ipQ7TT18 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Atf7ipQ7TT18 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Atf7ipQ7TT18 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Atf7ipQ7TT18 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Atf7ipQ7TT18 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Atf7ipQ7TT18 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Atf7ipQ7TT18 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Atf7ipQ7TT18 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms