Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH7

Kcnf1, Potassium voltage-gated channel subfamily F member 1, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnf1Q7TSH7 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kcnf1Q7TSH7 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kcnf1Q7TSH7 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kcnf1Q7TSH7 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kcnf1Q7TSH7 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kcnf1Q7TSH7 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kcnf1Q7TSH7 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kcnf1Q7TSH7 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kcnf1Q7TSH7 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kcnf1Q7TSH7 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kcnf1Q7TSH7 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kcnf1Q7TSH7 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kcnf1Q7TSH7 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kcnf1Q7TSH7 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kcnf1Q7TSH7 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kcnf1Q7TSH7 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kcnf1Q7TSH7 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kcnf1Q7TSH7 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kcnf1Q7TSH7 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kcnf1Q7TSH7 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kcnf1Q7TSH7 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kcnf1Q7TSH7 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kcnf1Q7TSH7 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kcnf1Q7TSH7 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kcnf1Q7TSH7 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kcnf1Q7TSH7 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kcnf1Q7TSH7 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kcnf1Q7TSH7 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kcnf1Q7TSH7 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kcnf1Q7TSH7 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kcnf1Q7TSH7 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kcnf1Q7TSH7 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kcnf1Q7TSH7 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kcnf1Q7TSH7 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kcnf1Q7TSH7 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kcnf1Q7TSH7 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kcnf1Q7TSH7 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kcnf1Q7TSH7 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kcnf1Q7TSH7 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Kcnf1Q7TSH7 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kcnf1Q7TSH7 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kcnf1Q7TSH7 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kcnf1Q7TSH7 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kcnf1Q7TSH7 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kcnf1Q7TSH7 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kcnf1Q7TSH7 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kcnf1Q7TSH7 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kcnf1Q7TSH7 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kcnf1Q7TSH7 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kcnf1Q7TSH7 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kcnf1Q7TSH7 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kcnf1Q7TSH7 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kcnf1Q7TSH7 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kcnf1Q7TSH7 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kcnf1Q7TSH7 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kcnf1Q7TSH7 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kcnf1Q7TSH7 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kcnf1Q7TSH7 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kcnf1Q7TSH7 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kcnf1Q7TSH7 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kcnf1Q7TSH7 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kcnf1Q7TSH7 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kcnf1Q7TSH7 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kcnf1Q7TSH7 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kcnf1Q7TSH7 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kcnf1Q7TSH7 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kcnf1Q7TSH7 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kcnf1Q7TSH7 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kcnf1Q7TSH7 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kcnf1Q7TSH7 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kcnf1Q7TSH7 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kcnf1Q7TSH7 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kcnf1Q7TSH7 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Kcnf1Q7TSH7 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kcnf1Q7TSH7 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kcnf1Q7TSH7 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kcnf1Q7TSH7 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kcnf1Q7TSH7 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kcnf1Q7TSH7 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kcnf1Q7TSH7 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kcnf1Q7TSH7 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kcnf1Q7TSH7 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kcnf1Q7TSH7 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kcnf1Q7TSH7 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kcnf1Q7TSH7 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kcnf1Q7TSH7 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kcnf1Q7TSH7 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kcnf1Q7TSH7 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kcnf1Q7TSH7 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kcnf1Q7TSH7 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kcnf1Q7TSH7 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kcnf1Q7TSH7 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kcnf1Q7TSH7 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kcnf1Q7TSH7 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kcnf1Q7TSH7 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kcnf1Q7TSH7 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kcnf1Q7TSH7 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kcnf1Q7TSH7 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kcnf1Q7TSH7 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kcnf1Q7TSH7 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms