Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH4

Ccp110, Centriolar coiled-coil protein of 110 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 1,004 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccp110Q7TSH4 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccp110Q7TSH4 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccp110Q7TSH4 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccp110Q7TSH4 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccp110Q7TSH4 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccp110Q7TSH4 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccp110Q7TSH4 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccp110Q7TSH4 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccp110Q7TSH4 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccp110Q7TSH4 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccp110Q7TSH4 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccp110Q7TSH4 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccp110Q7TSH4 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccp110Q7TSH4 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccp110Q7TSH4 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccp110Q7TSH4 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccp110Q7TSH4 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccp110Q7TSH4 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccp110Q7TSH4 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccp110Q7TSH4 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccp110Q7TSH4 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccp110Q7TSH4 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccp110Q7TSH4 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccp110Q7TSH4 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccp110Q7TSH4 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccp110Q7TSH4 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccp110Q7TSH4 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccp110Q7TSH4 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccp110Q7TSH4 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccp110Q7TSH4 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccp110Q7TSH4 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccp110Q7TSH4 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccp110Q7TSH4 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccp110Q7TSH4 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccp110Q7TSH4 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccp110Q7TSH4 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccp110Q7TSH4 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccp110Q7TSH4 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccp110Q7TSH4 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccp110Q7TSH4 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccp110Q7TSH4 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccp110Q7TSH4 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccp110Q7TSH4 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccp110Q7TSH4 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccp110Q7TSH4 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccp110Q7TSH4 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccp110Q7TSH4 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccp110Q7TSH4 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccp110Q7TSH4 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccp110Q7TSH4 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccp110Q7TSH4 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccp110Q7TSH4 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccp110Q7TSH4 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccp110Q7TSH4 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccp110Q7TSH4 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccp110Q7TSH4 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccp110Q7TSH4 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccp110Q7TSH4 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccp110Q7TSH4 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccp110Q7TSH4 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccp110Q7TSH4 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccp110Q7TSH4 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccp110Q7TSH4 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccp110Q7TSH4 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccp110Q7TSH4 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ccp110Q7TSH4 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ccp110Q7TSH4 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ccp110Q7TSH4 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccp110Q7TSH4 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccp110Q7TSH4 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccp110Q7TSH4 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccp110Q7TSH4 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccp110Q7TSH4 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccp110Q7TSH4 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccp110Q7TSH4 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccp110Q7TSH4 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccp110Q7TSH4 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccp110Q7TSH4 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccp110Q7TSH4 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccp110Q7TSH4 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccp110Q7TSH4 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccp110Q7TSH4 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccp110Q7TSH4 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccp110Q7TSH4 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccp110Q7TSH4 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccp110Q7TSH4 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccp110Q7TSH4 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccp110Q7TSH4 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccp110Q7TSH4 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccp110Q7TSH4 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccp110Q7TSH4 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccp110Q7TSH4 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccp110Q7TSH4 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccp110Q7TSH4 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccp110Q7TSH4 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccp110Q7TSH4 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccp110Q7TSH4 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccp110Q7TSH4 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccp110Q7TSH4 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccp110Q7TSH4 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms