Protein–RNA interactions for Protein: Q7TQ69

Tmc3, Transmembrane channel-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmc3Q7TQ69 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmc3Q7TQ69 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmc3Q7TQ69 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmc3Q7TQ69 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Tmc3Q7TQ69 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmc3Q7TQ69 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmc3Q7TQ69 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmc3Q7TQ69 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmc3Q7TQ69 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmc3Q7TQ69 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmc3Q7TQ69 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmc3Q7TQ69 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmc3Q7TQ69 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmc3Q7TQ69 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmc3Q7TQ69 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmc3Q7TQ69 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmc3Q7TQ69 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmc3Q7TQ69 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmc3Q7TQ69 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmc3Q7TQ69 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmc3Q7TQ69 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmc3Q7TQ69 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmc3Q7TQ69 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmc3Q7TQ69 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmc3Q7TQ69 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmc3Q7TQ69 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmc3Q7TQ69 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmc3Q7TQ69 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmc3Q7TQ69 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmc3Q7TQ69 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmc3Q7TQ69 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmc3Q7TQ69 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmc3Q7TQ69 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmc3Q7TQ69 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmc3Q7TQ69 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmc3Q7TQ69 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmc3Q7TQ69 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmc3Q7TQ69 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmc3Q7TQ69 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmc3Q7TQ69 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmc3Q7TQ69 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmc3Q7TQ69 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmc3Q7TQ69 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmc3Q7TQ69 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmc3Q7TQ69 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmc3Q7TQ69 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmc3Q7TQ69 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmc3Q7TQ69 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmc3Q7TQ69 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmc3Q7TQ69 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmc3Q7TQ69 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmc3Q7TQ69 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmc3Q7TQ69 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmc3Q7TQ69 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmc3Q7TQ69 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmc3Q7TQ69 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmc3Q7TQ69 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmc3Q7TQ69 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmc3Q7TQ69 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmc3Q7TQ69 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmc3Q7TQ69 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmc3Q7TQ69 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tmc3Q7TQ69 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tmc3Q7TQ69 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmc3Q7TQ69 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmc3Q7TQ69 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmc3Q7TQ69 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmc3Q7TQ69 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmc3Q7TQ69 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmc3Q7TQ69 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmc3Q7TQ69 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmc3Q7TQ69 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmc3Q7TQ69 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmc3Q7TQ69 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmc3Q7TQ69 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmc3Q7TQ69 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmc3Q7TQ69 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmc3Q7TQ69 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmc3Q7TQ69 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmc3Q7TQ69 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmc3Q7TQ69 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmc3Q7TQ69 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmc3Q7TQ69 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmc3Q7TQ69 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmc3Q7TQ69 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmc3Q7TQ69 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmc3Q7TQ69 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmc3Q7TQ69 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmc3Q7TQ69 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmc3Q7TQ69 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmc3Q7TQ69 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmc3Q7TQ69 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmc3Q7TQ69 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmc3Q7TQ69 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmc3Q7TQ69 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmc3Q7TQ69 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmc3Q7TQ69 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmc3Q7TQ69 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmc3Q7TQ69 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmc3Q7TQ69 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms