Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPQ3

Shprh, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, mousemouse

Predictions only

Length 1,674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ShprhQ7TPQ3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
ShprhQ7TPQ3 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
ShprhQ7TPQ3 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
ShprhQ7TPQ3 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ShprhQ7TPQ3 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
ShprhQ7TPQ3 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ShprhQ7TPQ3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ShprhQ7TPQ3 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ShprhQ7TPQ3 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ShprhQ7TPQ3 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ShprhQ7TPQ3 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
ShprhQ7TPQ3 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ShprhQ7TPQ3 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ShprhQ7TPQ3 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ShprhQ7TPQ3 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ShprhQ7TPQ3 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
ShprhQ7TPQ3 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
ShprhQ7TPQ3 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ShprhQ7TPQ3 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ShprhQ7TPQ3 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ShprhQ7TPQ3 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ShprhQ7TPQ3 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ShprhQ7TPQ3 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
ShprhQ7TPQ3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ShprhQ7TPQ3 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ShprhQ7TPQ3 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ShprhQ7TPQ3 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ShprhQ7TPQ3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ShprhQ7TPQ3 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ShprhQ7TPQ3 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ShprhQ7TPQ3 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
ShprhQ7TPQ3 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ShprhQ7TPQ3 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ShprhQ7TPQ3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ShprhQ7TPQ3 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ShprhQ7TPQ3 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
ShprhQ7TPQ3 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ShprhQ7TPQ3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ShprhQ7TPQ3 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
ShprhQ7TPQ3 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ShprhQ7TPQ3 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ShprhQ7TPQ3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ShprhQ7TPQ3 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ShprhQ7TPQ3 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ShprhQ7TPQ3 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ShprhQ7TPQ3 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ShprhQ7TPQ3 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ShprhQ7TPQ3 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ShprhQ7TPQ3 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ShprhQ7TPQ3 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ShprhQ7TPQ3 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ShprhQ7TPQ3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ShprhQ7TPQ3 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ShprhQ7TPQ3 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ShprhQ7TPQ3 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ShprhQ7TPQ3 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ShprhQ7TPQ3 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ShprhQ7TPQ3 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ShprhQ7TPQ3 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
ShprhQ7TPQ3 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
ShprhQ7TPQ3 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ShprhQ7TPQ3 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ShprhQ7TPQ3 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ShprhQ7TPQ3 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ShprhQ7TPQ3 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ShprhQ7TPQ3 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
ShprhQ7TPQ3 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ShprhQ7TPQ3 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ShprhQ7TPQ3 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ShprhQ7TPQ3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ShprhQ7TPQ3 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
ShprhQ7TPQ3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ShprhQ7TPQ3 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ShprhQ7TPQ3 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ShprhQ7TPQ3 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ShprhQ7TPQ3 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ShprhQ7TPQ3 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ShprhQ7TPQ3 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ShprhQ7TPQ3 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
ShprhQ7TPQ3 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ShprhQ7TPQ3 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ShprhQ7TPQ3 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ShprhQ7TPQ3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ShprhQ7TPQ3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ShprhQ7TPQ3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ShprhQ7TPQ3 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ShprhQ7TPQ3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ShprhQ7TPQ3 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ShprhQ7TPQ3 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ShprhQ7TPQ3 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ShprhQ7TPQ3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
ShprhQ7TPQ3 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ShprhQ7TPQ3 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ShprhQ7TPQ3 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ShprhQ7TPQ3 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
ShprhQ7TPQ3 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
ShprhQ7TPQ3 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ShprhQ7TPQ3 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ShprhQ7TPQ3 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ShprhQ7TPQ3 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 233.1 ms