Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNL3

Stk40, Serine/threonine-protein kinase 40, mousemouse

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stk40Q7TNL3 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Stk40Q7TNL3 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Stk40Q7TNL3 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Stk40Q7TNL3 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Stk40Q7TNL3 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Stk40Q7TNL3 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Stk40Q7TNL3 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Stk40Q7TNL3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Stk40Q7TNL3 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Stk40Q7TNL3 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Stk40Q7TNL3 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Stk40Q7TNL3 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Stk40Q7TNL3 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Stk40Q7TNL3 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Stk40Q7TNL3 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Stk40Q7TNL3 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Stk40Q7TNL3 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Stk40Q7TNL3 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Stk40Q7TNL3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Stk40Q7TNL3 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Stk40Q7TNL3 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Stk40Q7TNL3 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Stk40Q7TNL3 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Stk40Q7TNL3 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Stk40Q7TNL3 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Stk40Q7TNL3 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Stk40Q7TNL3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Stk40Q7TNL3 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Stk40Q7TNL3 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Stk40Q7TNL3 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Stk40Q7TNL3 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Stk40Q7TNL3 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Stk40Q7TNL3 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Stk40Q7TNL3 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Stk40Q7TNL3 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Stk40Q7TNL3 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Stk40Q7TNL3 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Stk40Q7TNL3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Stk40Q7TNL3 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Stk40Q7TNL3 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Stk40Q7TNL3 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Stk40Q7TNL3 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Stk40Q7TNL3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Stk40Q7TNL3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Stk40Q7TNL3 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Stk40Q7TNL3 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Stk40Q7TNL3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Stk40Q7TNL3 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Stk40Q7TNL3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Stk40Q7TNL3 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Stk40Q7TNL3 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Stk40Q7TNL3 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Stk40Q7TNL3 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Stk40Q7TNL3 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Stk40Q7TNL3 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Stk40Q7TNL3 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Stk40Q7TNL3 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Stk40Q7TNL3 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Stk40Q7TNL3 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Stk40Q7TNL3 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Stk40Q7TNL3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Stk40Q7TNL3 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Stk40Q7TNL3 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Stk40Q7TNL3 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Stk40Q7TNL3 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Stk40Q7TNL3 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Stk40Q7TNL3 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Stk40Q7TNL3 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Stk40Q7TNL3 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Stk40Q7TNL3 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Stk40Q7TNL3 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Stk40Q7TNL3 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Stk40Q7TNL3 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Stk40Q7TNL3 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Stk40Q7TNL3 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Stk40Q7TNL3 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Stk40Q7TNL3 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Stk40Q7TNL3 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Stk40Q7TNL3 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Stk40Q7TNL3 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Stk40Q7TNL3 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Stk40Q7TNL3 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Stk40Q7TNL3 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Stk40Q7TNL3 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Stk40Q7TNL3 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Stk40Q7TNL3 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Stk40Q7TNL3 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Stk40Q7TNL3 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Stk40Q7TNL3 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Stk40Q7TNL3 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Stk40Q7TNL3 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Stk40Q7TNL3 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Stk40Q7TNL3 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Stk40Q7TNL3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Stk40Q7TNL3 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Stk40Q7TNL3 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Stk40Q7TNL3 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Stk40Q7TNL3 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Stk40Q7TNL3 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Stk40Q7TNL3 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms