Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNL3

Stk40, Serine/threonine-protein kinase 40, mousemouse

Predictions only

Length 435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stk40Q7TNL3 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Stk40Q7TNL3 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Stk40Q7TNL3 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Stk40Q7TNL3 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Stk40Q7TNL3 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Stk40Q7TNL3 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Stk40Q7TNL3 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Stk40Q7TNL3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Stk40Q7TNL3 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Stk40Q7TNL3 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Stk40Q7TNL3 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Stk40Q7TNL3 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Stk40Q7TNL3 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Stk40Q7TNL3 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Stk40Q7TNL3 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Stk40Q7TNL3 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Stk40Q7TNL3 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Stk40Q7TNL3 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Stk40Q7TNL3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Stk40Q7TNL3 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Stk40Q7TNL3 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Stk40Q7TNL3 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Stk40Q7TNL3 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Stk40Q7TNL3 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Stk40Q7TNL3 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Stk40Q7TNL3 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Stk40Q7TNL3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Stk40Q7TNL3 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Stk40Q7TNL3 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Stk40Q7TNL3 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Stk40Q7TNL3 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Stk40Q7TNL3 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Stk40Q7TNL3 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Stk40Q7TNL3 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Stk40Q7TNL3 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Stk40Q7TNL3 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Stk40Q7TNL3 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Stk40Q7TNL3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Stk40Q7TNL3 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Stk40Q7TNL3 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Stk40Q7TNL3 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Stk40Q7TNL3 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Stk40Q7TNL3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Stk40Q7TNL3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Stk40Q7TNL3 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Stk40Q7TNL3 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Stk40Q7TNL3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Stk40Q7TNL3 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Stk40Q7TNL3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Stk40Q7TNL3 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Stk40Q7TNL3 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Stk40Q7TNL3 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Stk40Q7TNL3 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Stk40Q7TNL3 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Stk40Q7TNL3 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Stk40Q7TNL3 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Stk40Q7TNL3 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Stk40Q7TNL3 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Stk40Q7TNL3 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Stk40Q7TNL3 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Stk40Q7TNL3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Stk40Q7TNL3 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Stk40Q7TNL3 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Stk40Q7TNL3 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Stk40Q7TNL3 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Stk40Q7TNL3 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Stk40Q7TNL3 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Stk40Q7TNL3 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Stk40Q7TNL3 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Stk40Q7TNL3 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Stk40Q7TNL3 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Stk40Q7TNL3 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Stk40Q7TNL3 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Stk40Q7TNL3 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Stk40Q7TNL3 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Stk40Q7TNL3 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Stk40Q7TNL3 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Stk40Q7TNL3 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Stk40Q7TNL3 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Stk40Q7TNL3 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Stk40Q7TNL3 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Stk40Q7TNL3 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Stk40Q7TNL3 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Stk40Q7TNL3 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Stk40Q7TNL3 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Stk40Q7TNL3 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Stk40Q7TNL3 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Stk40Q7TNL3 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Stk40Q7TNL3 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Stk40Q7TNL3 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Stk40Q7TNL3 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Stk40Q7TNL3 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Stk40Q7TNL3 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Stk40Q7TNL3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Stk40Q7TNL3 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Stk40Q7TNL3 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Stk40Q7TNL3 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Stk40Q7TNL3 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Stk40Q7TNL3 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Stk40Q7TNL3 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms